当前解析结果
SmilChr01G001237| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001237 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001237 |
| 描述 | protein PATRONUS 2 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 24788419 - 24790824 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131006434 |
|---|---|
| GeneID | 131006434 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006434 |
| 原始查询 | SmilChr01G001237 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein PATRONUS 2 |
| 产物 | protein PATRONUS 2 |
| Arabidopsis | AT5G12360 (AT5G12360)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831111] identity=33; qcov=1.06; evalue=1.4e-20; confidence=low |
| Rice | -- |
| GO | GO:0007346 (regulation of mitotic cell cycle) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006434 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057789585.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057789585.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789585.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057789585.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057789585.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:24788604 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr1:24788607 |
CGT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 4 | B54,C19,C64,C82 |
Chr1:24788607 |
CGT |
C |
2bp_deletion | CDS_variant | 4 | B54,C19,C64,C82 |
Chr1:24788642 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B115,B20,B73,C36,C57 |
Chr1:24789481 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B118,B65 |
Chr1:24789507 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B125 |
Chr1:24789580 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B32,B94 |
Chr1:24789730 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B93,B94 |
Chr1:24789755 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。