当前解析结果
SmilChr01G001239| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001239 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001239 |
| 描述 | RNA polymerase II degradation factor 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 24797033 - 24810186 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131004779 |
|---|---|
| GeneID | 131004779 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131004779 |
| 原始查询 | SmilChr01G001239 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | RNA polymerase II degradation factor 1-like |
| 产物 | RNA polymerase II degradation factor 1-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131004779 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057787550.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057787550.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.60000 | XP_057787550.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.40000 | XP_057787550.1 |
| 5 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057787550.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:24797442 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | A15,B49,C10,C48,C62,C65 |
Chr1:24797451 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | B119,B134,B23,B63,C30,C63 |
Chr1:24797452 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B105,C61 |
Chr1:24797464 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,C75 |
Chr1:24797474 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B102,B104,B14,B18,B63 |
Chr1:24797475 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A4,B46,D10 |
Chr1:24797489 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B105,C61 |
Chr1:24797526 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B140,B38,B45,B56 |
Chr1:24797533 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B140,B38,B45,B56 |
Chr1:24797550 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | C38,D9 |
Chr1:24797550 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C38,D9 |
Chr1:24797559 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B67 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。