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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001246`

染色体: Chr01 坐标: 24971229-24973555 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001246`
名称	SmilChr01G001246
描述	uncharacterized SmilChr01G001246
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	24971229 - 24973555 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006436`
GeneID	`131006436`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006436`
原始查询	`SmilChr01G001246`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0100800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0100800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G24267` (AT1G24267) bZIP transcription factor, putative (DUF1664) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839042] identity=29.9; qcov=0.683; evalue=1.59e-10; confidence=low
Rice	`Os01g0100800` - identity=29.3; qcov=0.504; evalue=1.66e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07889 (DUF1664)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006436

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789587.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057789587.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789587.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789587.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789587.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:24971332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B5,B97,C46,C53
`Chr1:24971375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C78
`Chr1:24971775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,C54,C81,C87
`Chr1:24971782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:24971815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr1:24972034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B64
`Chr1:24972095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr1:24972219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C81
`Chr1:24973157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr1:24973164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C36
`Chr1:24973176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	72	A14,A23,A25,A6,A7,B100,B101,B102,B105,B125,B126,B13,B131,B132,B133,B136,B138,B140,B17,B18,B20,B23,B24,B3,B34,B35,B38,B40,B42,B46,B5,B50,B51,B52,B6,B63,B64,B66,B71,B76,B82,B91,B93,B98,C1,C17,C19,C21,C23,C29,C32,C35,C37,C44,C47,C49,C50,C57,C58,C61,C7,C70,C77,C8,C80,C81,C82,C85,D3,D5,D8,D9
`Chr1:24973208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B51,B98,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789587.1

230 aa

115

230

DUF1664

PF07889 DUF1664 1-94 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789587.1`	Pfam	`PF07889`	DUF1664	Coiled-coil	1	94	6.2e-21	75.4	Protein of unknown function (DUF1664)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933604.1
AGTAGTATTCAGTCATTCGTTTAATAGCATATGTTGAGACCTTGAGATATTATTTCCACTTTGAGCATTTTGTTACTTGAATATCTTGTGCGATGTAGTGTTTGCATATAAATAAATACATCTCTTAAAAACTTTTTACTCGTTAGGATTGGAAGTATGCATGGTTATACCCACCATTGTTTTAAGTGACTTTTCTTTTTGTACTGTCATGTTGCATATGGAAACATTTTACGTACTTCATGGAGATTTCACCACCTCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006436
ATGATGTTTGCAACAAGGGGTGGCTTAAATGATGCATGTTCTTCTGTAGCTAAACAGCTTGATAATGTTTACTCCTCCATTTCGGTTACTGAGAGAGATATGTCGTTGAAAATTCACCGAGTAGATTGTAAATATAATGTGGTTGCTGATAATACAACAGCAACGAAAGAGGAGGTGTCTGTACTGCGAGGTGATATGACATCGATTAGTTTAGAAATCGAGGATGTTACTCGTACAATTCAGATGATGGATTCTAGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789587.1
MMFATRGGLNDACSSVAKQLDNVYSSISVTERDMSLKIHRVDCKYNVVADNTTATKEEVSVLRGDMTSISLEIEDVTRTIQMMDSRINRMEVNQDEQNTGVCYLLGVNYARELEKSKSMEQIEPCQPVVSPPPSAIAGWMSTANQSMPHAAVAAAPHGLVQVNCEANILIVLIFGKILQLLTSEEGTKLQLEISVSASDIKEKYKDECKRVSKEEQVLRLDLSNKFQDVF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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