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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001248`

染色体: Chr01 坐标: 24997140-24997760 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001248`
名称	SmilChr01G001248
描述	uncharacterized SmilChr01G001248
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	24997140 - 24997760 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004996`
GeneID	`131004996`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004996`
原始查询	`SmilChr01G001248`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF4228 domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831109]; symbol=AT5G12340; hit=AT5G12340; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DUF4228 domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831109]; symbol=AT5G12340; hit=AT5G12340; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G12340` (AT5G12340) DUF4228 domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831109] identity=47.9; qcov=0.932; evalue=1.54e-57; confidence=high
Rice	`Os05g0385400` - identity=44.7; qcov=0.913; evalue=2.61e-38; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14009 (PADRE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004996

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057787759.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057787759.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057787759.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057787759.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787759.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:24997145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A22,B101,B23,C16
`Chr1:24997174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:24997280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr1:24997323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr1:24997349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B103,C30
`Chr1:24997352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:24997453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr1:24997552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:24997558`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C60
`Chr1:24997558`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C60
`Chr1:24997572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B54,C19,C64,C66,C82
`Chr1:24997578`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C35,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787759.1

206 aa

103

206

PADRE

PF14009 PADRE 1-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787759.1`	Pfam	`PF14009`	PADRE	Domain	1	184	8.7e-31	108.5	PADRE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931776.1
ATGGGCAACGCCTGCTTCTGCCCGCCATCCGCCGCCGTCAAACTCATAGGCGGCGGCGGCGGGGGCGGCACCAGGATCCTCACCGGCCGCAAGCACCTCGCCGGCGAGATAATGTTCGAGTTCCCGGAGCACATGGTGTGCGACGCGGCGTCGTTCTTCATCGGGCACCCGATCCCGTCGCTGGCCATCGACGACCACCTCGTCCCCGGCCGGACCTACTTCCTCCTGCCGCTCGACTGCATCACGAGCAACGTCCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131004996
ATGGGCAACGCCTGCTTCTGCCCGCCATCCGCCGCCGTCAAACTCATAGGCGGCGGCGGCGGGGGCGGCACCAGGATCCTCACCGGCCGCAAGCACCTCGCCGGCGAGATAATGTTCGAGTTCCCGGAGCACATGGTGTGCGACGCGGCGTCGTTCTTCATCGGGCACCCGATCCCGTCGCTGGCCATCGACGACCACCTCGTCCCCGGCCGGACCTACTTCCTCCTGCCGCTCGACTGCATCACGAGCAACGTCCTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787759.1
MGNACFCPPSAAVKLIGGGGGGGTRILTGRKHLAGEIMFEFPEHMVCDAASFFIGHPIPSLAIDDHLVPGRTYFLLPLDCITSNVLSTSSLAALASHCRPGSPVRFKDCPFEYLKGSDGRVLIKVMPEFIARLIAGESKVDGDGDGGASPSSVLCSTPELQKHYSQLVGPRDQLWSPKLETISEYKIRFSPCRFIGLEWKQKEVET

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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