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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001252`

染色体: Chr01 坐标: 25164388-25164972 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001252`
名称	SmilChr01G001252
描述	uncharacterized protein At2g29880-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	25164388 - 25164972 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005042`
GeneID	`131005042`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005042`
原始查询	`SmilChr01G001252`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784]; symbol=AT5G27260; hit=AT5G27260; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784]; symbol=AT5G27260; hit=AT5G27260; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G27260` (AT5G27260) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784] identity=43.6; qcov=0.982; evalue=1.09e-44; confidence=medium
Rice	`Os04g0590366` - identity=28.7; qcov=0.524; evalue=1.89e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005042

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057787823.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787823.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787823.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057787823.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057787823.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:25164403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	37	A21,A25,A5,B10,B108,B110,B111,B112,B121,B128,B24,B35,B41,B44,B5,B50,B53,B60,B61,B62,B65,B67,B72,B74,B81,B93,C12,C19,C26,C37,C45,C49,C50,C53,C70,C73,D3
`Chr1:25164406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B100
`Chr1:25164406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:25164445`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C53
`Chr1:25164445`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C53
`Chr1:25164478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr1:25164485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B24,C85,D10
`Chr1:25164501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	85	A13,A16,A18,A5,A6,B1,B102,B106,B110,B112,B113,B115,B119,B12,B121,B128,B129,B13,B134,B135,B20,B22,B24,B27,B28,B31,B32,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B41,B49,B56,B59,B60,B61,B67,B68,B71,B73,B79,B8,B81,B83,B89,B91,B93,B96,C13,C15,C16,C20,C27,C28,C29,C3,C35,C38,C39,C41,C42,C47,C48,C52,C53,C56,C58,C61,C62,C63,C65,C68,C75,C76,C77,C79,C8,C81,C87,D1,D3,D7
`Chr1:25164524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:25164565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	28	A23,B109,B118,B15,B19,B20,B23,B37,B48,B49,B69,B72,B82,B83,B94,B97,B98,C21,C22,C27,C29,C50,C63,C73,C79,C82,C83,D2
`Chr1:25164574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B54,C10,C69,D2
`Chr1:25164608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787823.1

166 aa

166

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 18-114 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787823.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	18	114	3.8e-18	67.0	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931840.1
ATGGGAGATTCTCAACAACAAGACACGAAAAAGAGGGCAGTCTATGAACCGTGGACTAAGGAACAAAGCGATGTATTGTTAGAAATTTTGGTTGAGTCTGCAAAACGGGGATGGCGTGATAATAGTGGTATATTTAGCAAAGCTACTGTTGAAGAAAGAATACTACCTGCTCTTAATCAAAGACTTCGGTGTAATAAGACTTATAACCACTACCTAAGCCGTATCAAATGGTTTAAGACCCGTTGGACTGCTTATTCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005042
ATGGGAGATTCTCAACAACAAGACACGAAAAAGAGGGCAGTCTATGAACCGTGGACTAAGGAACAAAGCGATGTATTGTTAGAAATTTTGGTTGAGTCTGCAAAACGGGGATGGCGTGATAATAGTGGTATATTTAGCAAAGCTACTGTTGAAGAAAGAATACTACCTGCTCTTAATCAAAGACTTCGGTGTAATAAGACTTATAACCACTACCTAAGCCGTATCAAATGGTTTAAGACCCGTTGGACTGCTTATTCAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787823.1
MGDSQQQDTKKRAVYEPWTKEQSDVLLEILVESAKRGWRDNSGIFSKATVEERILPALNQRLRCNKTYNHYLSRIKWFKTRWTAYSTLMKFNSGFGYDNNAKKFTAPDEVWDAYCQAHPKDAYLLHGNCPDYEDLEIAIGNGVAVGKNSIGLGSATDARTLGADKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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