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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001255`

染色体: Chr01 坐标: 25192537-25198619 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001255`
名称	SmilChr01G001255
描述	hydroxyproline O-arabinosyltransferase RDN2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	25192537 - 25198619 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024483`
GeneID	`131024483`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024483`
原始查询	`SmilChr01G001255`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hydroxyproline O-arabinosyltransferase RDN2-like
产物	hydroxyproline O-arabinosyltransferase RDN2-like
Arabidopsis	`AT5G13500` (AT5G13500) Hyp O-arabinosyltransferase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831194] identity=77.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0386000` - identity=72.3; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	smil00514 (Other types of O-glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF23452 (HPAT); PF28609 (HPAT_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024483

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057809975.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057809975.1`
3	Cis-golgi network	Cis-golgi network	0.20000	`XP_057809975.1`
4	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057809975.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809975.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:25195204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:25196051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B86,B94,C49
`Chr1:25196641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809975.1

359 aa

180

359

HPAT

HPAT_C

PF23452 HPAT 64-269 aa PF28609 HPAT_C 288-357 aa

XP_057809981.1

359 aa

180

359

HPAT

HPAT_C

PF23452 HPAT 64-269 aa PF28609 HPAT_C 288-357 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809975.1`	Pfam	`PF23452`	HPAT	Domain	64	269	5.2e-91	305.1	Hydroxyproline O-arabinosyltransferase family N-terminal domain
`XP_057809975.1`	Pfam	`PF28609`	HPAT_C	Domain	288	357	4.8e-29	100.7	Hydroxyproline O-arabinosyltransferase family C-terminal domain
`XP_057809981.1`	Pfam	`PF23452`	HPAT	Domain	64	269	5.2e-91	305.1	Hydroxyproline O-arabinosyltransferase family N-terminal domain
`XP_057809981.1`	Pfam	`PF28609`	HPAT_C	Domain	288	357	4.8e-29	100.7	Hydroxyproline O-arabinosyltransferase family C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953992.1
ATTCAATAATTTATCCGTTAGTTGAAACATAGAGAGAATACTTTACTCCCTCCGTCCACGAAATGAGTACCCATTTGTGGACGACACGAGTTTTAAAAAATATATTGAGTGTAGTGTGAATAGAATAAGGGTTTCATATTTTTTAGTGTATTAATTAAAATGTTTTGTGGGGTACACTTGCCAAAAAGGGAAATGGGTACTCATTTTGTGGACGGACGAAAAAGGAAATATGAGTACACATTTCGTGGATGGAGGTATCA...

XM_057953998.1
TAATTAAATATTGTCCCACGTCTAATTGTACATGGATCTCTGCGTGTACAAGTCCACTGCTACAAAACGTTGACATCAAACTCCTCTTCATTGCGTGTTTTAGTGTCTAATTGTGTTTTCGGCCGTGTTGTTCGCCCCTGAATTTGATTTGGTTGTGGTGAATTGCTGGAGGGATTTGGAGTTCTTGGGTTTTGTTTGGAGGAATTTGCGAAATAAGAGTTAATTAGATTGGATTCTCGGTGAAGCTTAGGATGAATACT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131024483
ATGAATACTAAGAAGAATGTGGGGCGTGCATCGCCCTTTTTGTTGGTGTTGTTGTCGTTTGGTTTCTTCCTAGCAACGTACAATTTGTTGATTTTGGTAATGCACAAGACTAGTAGGGGTGTTACGGAGGAGTTGCATGATCCAGTTGTTAGGAAGCCTGATGAGGTGAGGGAGGGCACTGGTGCAAAATTTCATGTTGCTTTGACAGCCACTGATGCGCCTTATAGCAAATGGCAATGCCGGATTATGTACTATTGGTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809975.1
MNTKKNVGRASPFLLVLLSFGFFLATYNLLILVMHKTSRGVTEELHDPVVRKPDEVREGTGAKFHVALTATDAPYSKWQCRIMYYWYKKMRDMPGSDMGGFTRVLHSGNPDNLMEEIPTVVVDPLPEGLDRGYIVLNRPWAFVQWLEKATIEEEYILMAEPDHVFVNPLPNLARGDHPAAFPFFYIKPTENEKIIRKYYPEDKGPVSNVDPIGNSPVIVKKSILEKIAPTWMNVSLRMKDDPETDKAFGWVLEMYGYAVA...

XP_057809981.1
MNTKKNVGRASPFLLVLLSFGFFLATYNLLILVMHKTSRGVTEELHDPVVRKPDEVREGTGAKFHVALTATDAPYSKWQCRIMYYWYKKMRDMPGSDMGGFTRVLHSGNPDNLMEEIPTVVVDPLPEGLDRGYIVLNRPWAFVQWLEKATIEEEYILMAEPDHVFVNPLPNLARGDHPAAFPFFYIKPTENEKIIRKYYPEDKGPVSNVDPIGNSPVIVKKSILEKIAPTWMNVSLRMKDDPETDKAFGWVLEMYGYAVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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