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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001261`

染色体: Chr01 坐标: 25304993-25307909 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001261`
名称	SmilChr01G001261
描述	mitochondrial inner membrane protease ATP23-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	25304993 - 25307909 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024389`
GeneID	`131024389`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024389`
原始查询	`SmilChr01G001261`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial inner membrane protease ATP23-like
产物	mitochondrial inner membrane protease ATP23-like
Arabidopsis	`AT3G03420` (AT3G03420) Ku70-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821258] identity=68.7; qcov=0.479; evalue=5.62e-26; confidence=medium
Rice	`Os12g0288900` - identity=60.9; qcov=0.457; evalue=1.78e-21; confidence=medium
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0031314 (extrinsic component of mitochondrial inner membrane); GO:0033615 (mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex assembly); GO:0034982 (mitochondrial protein processing)
KEGG	-
Pfam	PF09768 (Peptidase_M76)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024389

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057809875.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057809875.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809875.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809875.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809875.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:25305805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809875.1

140 aa

140

Peptidase_M76

PF09768 Peptidase_M76 70-134 aa

XP_057809883.1

140 aa

140

Peptidase_M76

PF09768 Peptidase_M76 70-134 aa

XP_057809895.1

140 aa

140

Peptidase_M76

PF09768 Peptidase_M76 70-134 aa

XP_057809904.1

140 aa

140

Peptidase_M76

PF09768 Peptidase_M76 70-134 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809875.1`	Pfam	`PF09768`	Peptidase_M76	Family	70	134	1.2e-16	61.7	Peptidase M76 family
`XP_057809883.1`	Pfam	`PF09768`	Peptidase_M76	Family	70	134	1.2e-16	61.7	Peptidase M76 family
`XP_057809895.1`	Pfam	`PF09768`	Peptidase_M76	Family	70	134	1.2e-16	61.7	Peptidase M76 family
`XP_057809904.1`	Pfam	`PF09768`	Peptidase_M76	Family	70	134	1.2e-16	61.7	Peptidase M76 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

26 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101849.1
AAAACTGTCCACTTTTTGATTGAAAAGACAAAAATACCCTTTACATTAAAATTTAAAAAAATGGCCACTTTCTCTAGCTCTCTTCCCTCGTCCTAATCGAGAACAAAATTTCCAACTTGTAAAATCCCTAACTTCATCTCCTTCAATTTCCGGCGAAGACCACCGCTATCAGTCCGACGCCGTCGCCGCCGTAGTTGCAGGGCCACCTGCGACGCCACACTCTCTTCTCCTTCAGGTAATGATCGAAATTCGGCGGATCG...

XR_009101827.1
AAAACTGTCCACTTTTTGATTGAAAAGACAAAAATACCCTTTACATTAAAATTTAAAAAAATGGCCACTTTCTCTAGCTCTCTTCCCTCGTCCTAATCGAGAACAAAATTTCCAACTTGTAAAATCCCTAACTTCATCTCCTTCAATTTCCGGCGAAGACCACCGCTATCAGTCCGACGCCGTCGCCGCCGTAGTTGCAGGGCCACCTGCGACGCCACACTCTCTTCTCCTTCAGGTAATGATCGAAATTCGGCGGATCG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131024389
ATGCTACTGATTCGTGGTATATTGAACTGCATTCTTGATACAAGCAAGATAGAAGCTGGGAAGATGCAGCTTGAGGAGCAAGTGTTCGACGTGGAGCAGCTTCTGGAGGACGTGGTTGATCTATACTATCCTGCTGGCATGAATAAAGGCGTAGACGTGATCTTGGATCCATGCGATGGCTCTGTCTCGAGATGTCGTTGGGCTATAGATGATCAGGTGGTGCAAGTGGTGATTCATGAGCTCGTTCGTGCTTATGATGA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057809875.1
MLLIRGILNCILDTSKIEAGKMQLEEQVFDVEQLLEDVVDLYYPAGMNKGVDVILDPCDGSVSRCRWAIDDQVVQVVIHELVRAYDECRAANLDWTNCAHHACNEYLLEHIRANHLSGYCHLKQELLRGHLKIKKILSQY

XP_057809883.1
MLLIRGILNCILDTSKIEAGKMQLEEQVFDVEQLLEDVVDLYYPAGMNKGVDVILDPCDGSVSRCRWAIDDQVVQVVIHELVRAYDECRAANLDWTNCAHHACNEYLLEHIRANHLSGYCHLKQELLRGHLKIKKILSQY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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