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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001282`

染色体: Chr01 坐标: 25600152-25602442 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001282`
名称	SmilChr01G001282
描述	uncharacterized SmilChr01G001282
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	25600152 - 25602442 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005117`
GeneID	`131005117`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005117`
原始查询	`SmilChr01G001282`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=38; qcov=0.708; evalue=2.19e-36; confidence=medium
Rice	`Os11g0577650` - identity=49.4; qcov=0.677; evalue=3.85e-55; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005117

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057787918.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787918.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787918.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057787918.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057787918.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:25601362`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A13,B112,B25,B75,C42,C46
`Chr1:25601386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:25601401`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A5,B103,B111,B112,B137,B21,B28,B31,B54,B60,C27,C37,C43,C45,C61,C9
`Chr1:25601410`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	52	A10,A19,A20,A24,A6,A9,B1,B108,B110,B112,B113,B121,B128,B138,B140,B20,B39,B53,B75,B76,B80,B83,B96,C10,C16,C19,C2,C23,C24,C25,C28,C3,C33,C46,C47,C49,C54,C57,C6,C64,C66,C68,C7,C70,C77,C82,C85,C86,D4,D5,D7,D8
`Chr1:25601413`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	69	A10,A15,A19,A20,A24,A5,A6,A9,B1,B103,B108,B110,B111,B112,B113,B121,B128,B137,B138,B140,B16,B20,B21,B28,B31,B39,B53,B54,B60,B74,B75,B76,B80,B83,B96,C10,C16,C19,C2,C23,C24,C27,C28,C3,C33,C37,C43,C45,C46,C49,C54,C57,C6,C61,C64,C66,C68,C7,C70,C77,C80,C82,C85,C86,C9,D4,D5,D7,D8
`Chr1:25601633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr1:25601650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr1:25601652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr1:25601659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr1:25601665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	63	A14,A19,A24,A7,A8,B1,B101,B102,B105,B117,B12,B123,B125,B13,B130,B14,B15,B17,B2,B27,B31,B33,B35,B49,B56,B58,B59,B6,B67,B68,B69,B74,B81,B85,B89,B90,B92,B94,B95,C14,C15,C17,C19,C20,C28,C29,C31,C36,C4,C41,C42,C46,C48,C49,C51,C62,C64,C65,C66,C75,C87,D1,D6
`Chr1:25601684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C87
`Chr1:25601699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B76,B80,C40,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787918.1

260 aa

130

260

DUF8040

DDE_Tnp_4

PF26138 DUF8040 72-124 aa PF13359 DDE_Tnp_4 157-247 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787918.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	72	124	1.3e-11	45.0	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057787918.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	157	247	2e-11	44.5	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931935.1
ATGTCTGGGGGGGAGCGTATTCGTGATTCTGATATCGTGTATTTGCTGTTGCAAGAAGTGCTGAGACACCATTTGATTCAAATATCTATAGTCATTGCATATGTTGGTAAACTAACTTCAAACAAGAGAAAGTGTATTAGATTGTGTCGCAAACCTTCGTATGGATCGAAATGCCTTCGGCCGGCTGTGTCGTATTCTAAGGGATATGGGGGGGGGTTAGTAGATGGGAATTACGTTGTCGTCGAAGAACAGGTAGCTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005117
ATGTCTGGGGGGGAGCGTATTCGTGATTCTGATATCGTGTATTTGCTGTTGCAAGAAGTGCTGAGACACCATTTGATTCAAATATCTATAGTCATTGCATATGTTGGTAAACTAACTTCAAACAAGAGAAAGTGTATTAGATTGTGTCGCAAACCTTCGTATGGATCGAAATGCCTTCGGCCGGCTGTGTCGTATTCTAAGGGATATGGGGGGGGGTTAGTAGATGGGAATTACGTTGTCGTCGAAGAACAGGTAGCTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787918.1
MSGGERIRDSDIVYLLLQEVLRHHLIQISIVIAYVGKLTSNKRKCIRLCRKPSYGSKCLRPAVSYSKGYGGGLVDGNYVVVEEQVAIFVSVLAHHKKNRVVGFDFRWSGQTISHYVHAVLGAVLRLHDIFLAKPEAVSDDCTDGRWQWFKGCLGALDGTYANVLVSKTDTPRYRTRKGEISTNVLAVCDRDLQFVYALSGWEGSASDSRILRDSLARPHGLKVPKGKYYLCDNGYANSEGFLTPFKGLRYHLKEWGPTAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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