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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001285`

染色体: Chr01 坐标: 25626819-25627463 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001285`
名称	SmilChr01G001285
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00810-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	25626819 - 25627463 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005137`
GeneID	`131005137`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005137`
原始查询	`SmilChr01G001285`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`ATMG00810` - identity=36.8; qcov=0.799; evalue=7.53e-37; confidence=medium
Rice	`Os08g0125300` - identity=45.8; qcov=1; evalue=1.41e-56; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07727 (RVT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005137

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057787939.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787939.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787939.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787939.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057787939.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:25626822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B124,C67
`Chr1:25626823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C46
`Chr1:25626839`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A23,A9,B110,B135,B36,B38,B40,B51,B53,B6,B74,B87,C16,C20,C22,C24,C28,C46,C47,C67,D4
`Chr1:25626938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B120,B81,C57,C77
`Chr1:25626944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B133,B16,B79
`Chr1:25627016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr1:25627024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:25627053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,C32,C46,C67
`Chr1:25627059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C46,C67
`Chr1:25627082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:25627248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A3,B10,B103,B105,B122,B2,B55,B84,B86,C14,C2,C21,C25,C45,C71,C9,D1,D4
`Chr1:25627296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787939.1

214 aa

107

214

RVT_2

PF07727 RVT_2 2-114 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787939.1`	Pfam	`PF07727`	RVT_2	Domain	2	114	1.1e-27	98.0	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931956.1
ATGGCGTGGAATAGCAGGATTGGCAAGTACTATTTAGAAGATAATGGCTTCATCAAATGTCCACATGAACATGCGCTCTACGTTAAAAGTAAGGGAGGAAATATTTTAATAGTGTGCTTGTATGTGGATGATCTCATCTTCACAGGAAATAATCTAAGTATGTTCGAGGAATTCAAGAAGGTAATGACAAAGGAATTCGAAATGACAGACATTGGGCTGATGACATATTACCTAGGTGTGGAAGTCAAACAACTCAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005137
ATGGCGTGGAATAGCAGGATTGGCAAGTACTATTTAGAAGATAATGGCTTCATCAAATGTCCACATGAACATGCGCTCTACGTTAAAAGTAAGGGAGGAAATATTTTAATAGTGTGCTTGTATGTGGATGATCTCATCTTCACAGGAAATAATCTAAGTATGTTCGAGGAATTCAAGAAGGTAATGACAAAGGAATTCGAAATGACAGACATTGGGCTGATGACATATTACCTAGGTGTGGAAGTCAAACAACTCAAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787939.1
MAWNSRIGKYYLEDNGFIKCPHEHALYVKSKGGNILIVCLYVDDLIFTGNNLSMFEEFKKVMTKEFEMTDIGLMTYYLGVEVKQLKNGIFITQEGYVKEILKKFKMEDCKAINTLVECGIKLSKNDGKEKVDPTLFKSLVESLRYLTCTKPYILYATGLVSRYMENPTSIHFKAAKRILRYLKGTIGYGLFYSNTDDYKLVGYSDNDWAGDNDD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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