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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001288`

染色体: Chr01 坐标: 25674974-25676465 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001288`
名称	SmilChr01G001288
描述	uncharacterized SmilChr01G001288
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	25674974 - 25676465 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016755`
GeneID	`131016755`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016755`
原始查询	`SmilChr01G001288`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	maternal effect embryo arrest protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819939]; symbol=AT3G07510; hit=AT3G07510; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	maternal effect embryo arrest protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819939]; symbol=AT3G07510; hit=AT3G07510; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G07510` (AT3G07510) maternal effect embryo arrest protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819939] identity=50.3; qcov=0.718; evalue=3.09e-40; confidence=medium
Rice	`Os10g0178200` - identity=43; qcov=0.727; evalue=1.77e-38; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016755

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801462.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801462.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801462.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801462.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801462.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:25675113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B29
`Chr1:25675382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B19,B62,B94
`Chr1:25675385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B21,C10,C73
`Chr1:25675417`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	197	A1,A10,A11,A13,A14,A16,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B106,B108,B11,B110,B111,B112,B114,B115,B117,B118,B12,B120,B121,B123,B124,B125,B126,B127,B129,B13,B130,B132,B133,B135,B136,B137,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B23,B24,B26,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B44,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B51,B53,B54,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B63,B64,B65,B66,B68,B69,B71,B72,B73,B75,B76,B79,B8,B80,B81,B83,B84,B85,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C30,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C40,C41,C42,C43,C44,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C52,C55,C58,C59,C6,C60,C62,C64,C65,C66,C67,C69,C71,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D5,D6,D7,D9
`Chr1:25675421`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	181	A1,A10,A13,A14,A16,A19,A2,A20,A21,A23,A24,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B103,B106,B108,B11,B110,B114,B115,B117,B12,B120,B121,B123,B124,B125,B127,B129,B13,B130,B132,B133,B135,B136,B137,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B20,B21,B23,B24,B26,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B35,B36,B44,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B51,B53,B54,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B63,B64,B65,B66,B68,B69,B71,B72,B73,B75,B76,B77,B79,B8,B80,B81,B83,B84,B85,B87,B89,B9,B90,B92,B94,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C21,C22,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C30,C33,C34,C35,C37,C39,C40,C41,C42,C44,C46,C47,C49,C5,C50,C52,C55,C58,C59,C6,C60,C62,C64,C65,C66,C67,C69,C71,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D5,D6,D7,D9
`Chr1:25675444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr1:25675472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B89,B99,C1
`Chr1:25675490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B101,B27,B94,C49
`Chr1:25675493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B32,C37
`Chr1:25675577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C58
`Chr1:25675821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945479.1
TGCCAAACCAAACCTTGTATATATATATAACCCACACACCCACACTTCAAATTATAGAAACAATATTTACATCAACAGCATTACATATTTAAAAAAACAAACTAATGAGCAGACGACGTCTTAGCATCAATCCCCTCACCTCTCCAACTTTGAACGAATTGGAAATGCAAGACAACACAAGCACTGCCGCCGCCGCTGCGGCCGTGGCCGTGGCCCCCGCCCCCGCCCCCGAGCCCGGGAAAACGAGCATCCACGTGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016755
ATGAGCAGACGACGTCTTAGCATCAATCCCCTCACCTCTCCAACTTTGAACGAATTGGAAATGCAAGACAACACAAGCACTGCCGCCGCCGCTGCGGCCGTGGCCGTGGCCCCCGCCCCCGCCCCCGAGCCCGGGAAAACGAGCATCCACGTGACGGCCCTGGACGGCATAGTGAACGTCAACTCCCTCTTCACGATGTCGTTGTTCATCGGCTTCTCCATGACCGTCCCACAGAACGCCACCACCGCGTCAAGCGCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801462.1
MSRRRLSINPLTSPTLNELEMQDNTSTAAAAAAVAVAPAPAPEPGKTSIHVTALDGIVNVNSLFTMSLFIGFSMTVPQNATTASSAACTTSAETVRRLIVFEVISFSFFLFSSLVAQSLKLQINLRNNMDPTDPHKGDIGIDHLKYCLFGSAVGSVLGCTFLTMSIVDFIRVKLGSLSCGGKPVYAVVTLLVFVGSGLLIYVITAARAAFIVQNEPPASTVEENVRA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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