当前解析结果
SmilChr01G001298| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001298 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001298 |
| 描述 | Holliday junction resolvase MOC1, chloroplastic |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 25852533 - 25856306 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016815 |
|---|---|
| GeneID | 131016815 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016815 |
| 原始查询 | SmilChr01G001298 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | Holliday junction resolvase MOC1, chloroplastic |
| 产物 | Holliday junction resolvase MOC1%2C chloroplastic |
| Arabidopsis | AT2G26840 (AT2G26840)MutS2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817225] identity=59; qcov=0.707; evalue=1.24e-80; confidence=high |
| Rice | Os01g0268900- identity=62.3; qcov=0.548; evalue=3.85e-63; confidence=medium |
| GO | GO:0008821 (crossover junction DNA endonuclease activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016815 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057801551.1 |
| 2 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.20000 | XP_057801551.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057801551.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801551.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057801551.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:25852616 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B103 |
Chr1:25852839 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C48 |
Chr1:25852841 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B54 |
Chr1:25852974 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C12,C55,C6 |
Chr1:25855197 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,C48 |
Chr1:25855461 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr1:25855494 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B114,B16 |
Chr1:25856003 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C83 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。