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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001305`

染色体: Chr01 坐标: 26000900-26005209 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001305`
名称	SmilChr01G001305
描述	B3 domain-containing protein Os03g0120900-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	26000900 - 26005209 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005194`
GeneID	`131005194`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005194`
原始查询	`SmilChr01G001305`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B3 domain-containing protein Os03g0120900-like
产物	B3 domain-containing protein Os03g0120900-like
Arabidopsis	`AT2G46870` (NGA1) AP2/B3-like transcriptional factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819300] identity=60; qcov=0.682; evalue=1.7e-43; confidence=medium
Rice	`Os03g0120900` - identity=51.7; qcov=0.879; evalue=7.48e-48; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005194

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788014.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788014.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788014.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788014.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788014.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:26000911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B1,B70
`Chr1:26004681`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	71	A11,A14,A18,A19,A21,A23,A24,A3,A5,A6,A8,B1,B102,B105,B106,B109,B11,B114,B121,B124,B133,B135,B139,B19,B2,B21,B23,B25,B3,B32,B41,B42,B46,B47,B49,B57,B69,B70,B72,B78,B79,B83,B86,B87,B90,B92,B99,C12,C13,C14,C18,C24,C29,C35,C36,C40,C41,C42,C44,C50,C52,C65,C72,C74,C75,C81,C84,C85,D1,D3,D6
`Chr1:26004691`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B121,B42,B60,C14,D1
`Chr1:26004691`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B121,B42,B60,C14,D1
`Chr1:26004693`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B121,B42,B60,C14,D1
`Chr1:26004693`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B121,B42,B60,C14,D1
`Chr1:26004751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B135,C21
`Chr1:26004807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B38,C52
`Chr1:26004812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B38,C52
`Chr1:26004828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr1:26004829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,B45
`Chr1:26004836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,C10,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788014.1

198 aa

198

PF02362 B3 36-90 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788014.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	36	90	1.2e-17	64.4	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932031.1
ATGCCTCTTATCAGACTCGAGATTCTTTATCTTCCCGACAACGTTTCCCCCTCTCTCTCTCACACCCCAATCTCTCTCTCTCTCTTCCCACTGGACTCGTCCACAAACGAGAAGGGTTTGCTGCTGAATTTTGAGGACCGGAACGGGAAGCCATGGCGGTTTCGCTACTCCTACTGGAACAACAGCCAGAGCTACGTGATGACCAAGGGTTGGTCCCGCTTCGTCAAGGAGAAGAAGCTCGACGCCGGCGACATCGTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005194
ATGCCTCTTATCAGACTCGAGATTCTTTATCTTCCCGACAACGTTTCCCCCTCTCTCTCTCACACCCCAATCTCTCTCTCTCTCTTCCCACTGGACTCGTCCACAAACGAGAAGGGTTTGCTGCTGAATTTTGAGGACCGGAACGGGAAGCCATGGCGGTTTCGCTACTCCTACTGGAACAACAGCCAGAGCTACGTGATGACCAAGGGTTGGTCCCGCTTCGTCAAGGAGAAGAAGCTCGACGCCGGCGACATCGTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788014.1
MPLIRLEILYLPDNVSPSLSHTPISLSLFPLDSSTNEKGLLLNFEDRNGKPWRFRYSYWNNSQSYVMTKGWSRFVKEKKLDAGDIVSFQRGVGELAKDHLFIDWRPAPDLPPSHHFSFHQRSSSLHHPWSPLFIPPPPPPRNYSHLLHHHYHHHHYPPTGYGPYAYGSVVNGNPCPPGSIVYLRGGGGGAGAKRADGF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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