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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001307`

染色体: Chr01 坐标: 26033520-26039503 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001307`
名称	SmilChr01G001307
描述	uncharacterized SmilChr01G001307
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	26033520 - 26039503 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016898`
GeneID	`131016898`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016898`
原始查询	`SmilChr01G001307`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transferring glycosyl group transferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831101]; symbol=AT5G12260; hit=AT5G12260; species=arabidopsis; confidence=high
产物	transferring glycosyl group transferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831101]; symbol=AT5G12260; hit=AT5G12260; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G12260` (AT5G12260) transferring glycosyl group transferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831101] identity=52.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0283000` (OSJNBa0004B13.7) - identity=50.5; qcov=0.935; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28143 (SPBC1E8_03c_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016898

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057801679.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057801679.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801679.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801679.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801679.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:26036505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B60
`Chr1:26036691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:26036740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:26036815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:26036861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B41,C10,C35
`Chr1:26037071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr1:26037098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr1:26037172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:26037280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr1:26037684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:26038677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:26038868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801679.1

616 aa

308

616

SPBC1E8_03c_C

PF28143 SPBC1E8_03c_C 67-237 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801679.1`	Pfam	`PF28143`	SPBC1E8_03c_C	Domain	67	237	4.6e-12	46.7	SPBC1E8.03c C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099252.1
TGATTCGATTATGAGTATAATCGATTAATCGTACCTGTTTTGCCATCCCTAATTTGAACCCTAAGATGACTATTAAACGACAAATGATTTCTTCGCTCGTTTTCTTTTCTTGAAAATAGTTCGATTTAATTTCATAATTAGCATTCTATTTGAATCTTGAAGGAGCAAAACAATTCCCCAACGAACATATACATCTGTATCTGCGATGATGACATAGTTGCGGCGAAGTGATGGCCCCTCAAAGCAGAAGACAGCTCTCA...

XR_009099251.1
TGATTCGATTATGAGTATAATCGATTAATCGTACCTGTTTTGCCATCCCTAATTTGAACCCTAAGATGACTATTAAACGACAAATGATTTCTTCGCTCGTTTTCTTTTCTTGAAAATAGTTCGATTTAATTTCATAATTAGCATTCTATTTGAATCTTGAAGGAGCAAAACAATTCCCCAACGAACATATACATCTGTATCTGCGATGATGACATAGTTGCGGCGAAGTGATGGCCCCTCAAAGCAGAAGACAGCTCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016898
ATGGCCCCTCAAAGCAGAAGACAGCTCTCACTGCTCCTCATCCTCCTCTTCCTCCTCCTCTCTCTCTCCTCTCTCTTCCTCTCCCCCTCCGCTCCCAACCCCCAAATCCACTCGCCACTCCACTCACTCCCAACCCCATCCCCTCCCCCCAACTTCACCTTTCTCATCAAAGTCCTCACCTTCAACCGCCTCTCCTCTCTCTCCCGCTGCCTCAACTCTCTTGCCAATGCCCACTACGATGCCGCCGACAAAGTTCATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801679.1
MAPQSRRQLSLLLILLFLLLSLSSLFLSPSAPNPQIHSPLHSLPTPSPPPNFTFLIKVLTFNRLSSLSRCLNSLANAHYDAADKVHLHIYIDHFPLDSADSDQRLNLSKQILDFVDGFDWRFGEKLVHYRTSNAGLQAQWLEAWWPSSDHEFAFVVEDDLEVSPLYYRFLKAVILNYYYNATNFSPSIYGASLQRPRFVPGKHGNKMQLDGESQIFLYQLVGTWGQLLFPRPWKEFRLWYNMHKSKGVKPFLDGMVTNGW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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