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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001308`

染色体: Chr01 坐标: 26033591-26035663 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001308`
名称	SmilChr01G001308
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 4.6-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	26033591 - 26035663 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016910`
GeneID	`131016910`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016910`
原始查询	`SmilChr01G001308`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 4.6-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 4.6-like
Arabidopsis	`AT1G69850` (NRT1:2) nitrate transporter 1:2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843321] identity=41.8; qcov=1.02; evalue=3.43e-141; confidence=medium
Rice	`Os01g0748950` - identity=42.8; qcov=1.02; evalue=3.9e-145; confidence=medium
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016910

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801698.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057801698.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057801698.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801698.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801698.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:26033814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,D11
`Chr1:26033822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:26033848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,D9
`Chr1:26033860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B63,C39
`Chr1:26034074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:26034116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C2,D9
`Chr1:26034131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B113,B82,B88,C10
`Chr1:26034132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C2,D9
`Chr1:26034212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B8
`Chr1:26034380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C2,D9
`Chr1:26034396`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B6
`Chr1:26034396`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801698.1

549 aa

274

549

PTR2

PF00854 PTR2 80-490 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801698.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	80	490	1.1e-81	275.4	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945715.1
ATGAGGTATGATGATCCTGAAAGACAGGGTGGATTCAGGGCATGCATGTTCGTTTTCGTGTTGGCAATGTTGGAGAACATCGGATTTGTAGCAAACATGTCGAGCATGGTTCTCTACTTCCACCTGTTTTTCGACCTCTCGTCGGCGGCAAACACGCTCACCAACTTCCTAGGCTCGACGTTCTTGCTCACCGTTCTTGGAGGCTTCATCTCCGACACGTACTTGAGCCGGCTGCATACCTGCCTCATTTTCGGATTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016910
ATGAGGTATGATGATCCTGAAAGACAGGGTGGATTCAGGGCATGCATGTTCGTTTTCGTGTTGGCAATGTTGGAGAACATCGGATTTGTAGCAAACATGTCGAGCATGGTTCTCTACTTCCACCTGTTTTTCGACCTCTCGTCGGCGGCAAACACGCTCACCAACTTCCTAGGCTCGACGTTCTTGCTCACCGTTCTTGGAGGCTTCATCTCCGACACGTACTTGAGCCGGCTGCATACCTGCCTCATTTTCGGATTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801698.1
MRYDDPERQGGFRACMFVFVLAMLENIGFVANMSSMVLYFHLFFDLSSAANTLTNFLGSTFLLTVLGGFISDTYLSRLHTCLIFGFLEITGLLMLTIQAHSRKSQIVPCNKPSCIGGTDAAMFYASLCILALGCGGVKGSVAALGADQFDRTDTEGAKGVASYFNFYQFSTTVGSLIGVTAVVWIALNRGWHWAFFTGLATAFVGFFVLALGKRFYLFQPLANSPIVRVSQVIITAVRNRNLKFPESSVELYEADDKEKD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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