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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001329`

染色体: Chr01 坐标: 26464086-26473494 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001329`
名称	SmilChr01G001329
描述	SNF1-related protein kinase regulatory subunit beta-1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	26464086 - 26473494 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017114`
GeneID	`131017114`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017114`
原始查询	`SmilChr01G001329`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SNF1-related protein kinase regulatory subunit beta-1
产物	SNF1-related protein kinase regulatory subunit beta-1
Arabidopsis	`AT5G21170` (AKINBETA1) 5'-AMP-activated protein kinase beta-2 subunit protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832243] identity=57.1; qcov=1.03; evalue=7.51e-102; confidence=high
Rice	`Os05g0491200` (akin-b) - identity=50.9; qcov=1.04; evalue=3.36e-89; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF04739 (AMPKBI); PF16561 (AMPK1_CBM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017114

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057801840.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057801840.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057801840.1`
4	Endosome	内体	0.20000	`XP_057801840.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801840.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:26464629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,C82,D5
`Chr1:26469825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr1:26469922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B7
`Chr1:26470177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B27,B94,C49,C7
`Chr1:26470207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B7
`Chr1:26472961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C35
`Chr1:26472962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr1:26472965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B4,B48,C25,C36,D2
`Chr1:26473060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801840.1

274 aa

137

274

AMPK1_CBM

AMPKBI

PF16561 AMPK1_CBM 90-170 aa PF04739 AMPKBI 202-271 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801840.1`	Pfam	`PF16561`	AMPK1_CBM	Family	90	170	2.1e-29	102.3	Glycogen recognition site of AMP-activated protein kinase
`XP_057801840.1`	Pfam	`PF04739`	AMPKBI	Family	202	271	2.7e-21	76.1	5'-AMP-activated protein kinase beta subunit, interaction domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945857.1
GGATGTGACCTGCAAACTGCATATGATTAAAAACGAAAAAAGGTGATTTGAAATGATTTTATTTTTGTTCTTTTGAGTACGAAATGATTTTCAATTTTAAACTTATCTTTCTCGGAAGCGACACGCATTCGCCGCAATGAGTCAAAATGAACTCGTTGATCAGAATTTGAACGACGACGATTTCACTGCGAAAATAGTTCTTATCCAAATTTGACGACCACGATTATCCCACGTACTCAAATCTATCCTTTCAATTTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017114
ATGGGAAATGCGAATGGCAAAGAAGAAGGCAGTGAAAATGGCGGCGCCGAGGTCTCCGAAGGTTCCAACCACGCGCCGGCAAATCGCGTGGCTTCCGCTGATCTAATGGTGAGCTCTCCGCCGCGTGATCCCCATCAGTCGCGCGCTCCTCTCTTGTTTTCGTCTCAGGCCCCAGTACTTCCTATACAAAGAAGTGATGGCCCGTCACTCAACCCACTGAGGCAGAATGAAGCTCAAAGAGCTGTTGATCACCCCCTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801840.1
MGNANGKEEGSENGGAEVSEGSNHAPANRVASADLMVSSPPRDPHQSRAPLLFSSQAPVLPIQRSDGPSLNPLRQNEAQRAVDHPLELGIPTIITWSFGGSNVVVEGSWDNWRTRKMLQRSGKDHSILLVLPSGIFRYRFIVDGEVRYIPDLPTETDQTGHICNLLDVHDYVPENLDSVAEFEAPQSPESSYSQDFPGDEDFAKDPLLVPPQLASSVLSSENYKDTSASKPQHVVLNHLFMEKERPSQSVVALGLTHRFQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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