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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001343`

染色体: Chr01 坐标: 26698517-26699396 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001343`
名称	SmilChr01G001343
描述	uncharacterized SmilChr01G001343
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	26698517 - 26699396 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017322`
GeneID	`131017322`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017322`
原始查询	`SmilChr01G001343`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G35695` (AT5G35695) nuclease HARBI1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833543] identity=38.5; qcov=1.03; evalue=1.46e-37; confidence=medium
Rice	`Os03g0643050` - identity=47.7; qcov=1.06; evalue=1.66e-52; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017322

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802023.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057802023.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057802023.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802023.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802023.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:26698646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B52,B58,C37,C55,D3
`Chr1:26698653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B52,B58,C37,C55,D3
`Chr1:26698675`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B58
`Chr1:26698675`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B58
`Chr1:26698707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,D6
`Chr1:26698708`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:26698732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:26698752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:26698785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,C21,C71
`Chr1:26698919`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B115,B81,C6
`Chr1:26698919`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B115,B81,C6
`Chr1:26698924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802023.1

187 aa

187

DDE_Tnp_4

DDE_Tnp_1

Plant_tran

PF13359 DDE_Tnp_4 2-126 aa PF01609 DDE_Tnp_1 12-125 aa PF04827 Plant_tran 71-129 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802023.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	2	126	2.5e-15	57.2	DDE superfamily endonuclease
`XP_057802023.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	12	125	6.4e-06	26.8	Transposase DDE domain
`XP_057802023.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	71	129	3.8e-06	27.4	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946040.1
GGTGCATTAGACGGTACATACATCAATGTTATGGTGCCGAATATTGATAAACCGCGGTATCGAACGAGGAAGGGATAAATTTCAACAAATACACTTGCAGTTTGTGACAAAAATATGAAGTTTGTGTACGTTTTGCCGGGATGGGAGGGATCAGCGGCGGATGCTAGAATCTTGCGCGATGCGTTGAACAGACCTAATGGATTCAAGGTACCCAGGGGCTTATACTATCTCGTGGATAATGGATATGTCAATTCTGAGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017322
ATGAAGTTTGTGTACGTTTTGCCGGGATGGGAGGGATCAGCGGCGGATGCTAGAATCTTGCGCGATGCGTTGAACAGACCTAATGGATTCAAGGTACCCAGGGGCTTATACTATCTCGTGGATAATGGATATGTCAATTCTGAGGGGTTTCTCGCTCCCTACAAAGGGGTTCGGTATCATCTTAAAGAATGGGGACCGATGGCTGCACGCCCACAAAATGCTGAAGAATTGTTCAATATGCGCCATACGAAGGCTCGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802023.1
MKFVYVLPGWEGSAADARILRDALNRPNGFKVPRGLYYLVDNGYVNSEGFLAPYKGVRYHLKEWGPMAARPQNAEELFNMRHTKARNVIERAFGVMKMRWGILRSTTFYPVKVQNRLIMACFLLNNFIRTEMDVDHLVQAFDNLPQDNEFNEPEHGDYVDAVKPSREWVANRDAIAQTMWQQYVAMH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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