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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001353`

染色体: Chr01 坐标: 26804049-26809727 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001353`
名称	SmilChr01G001353
描述	uncharacterized SmilChr01G001353
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	26804049 - 26809727 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005322`
GeneID	`131005322`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005322`
原始查询	`SmilChr01G001353`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0460733; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os10g0460733; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=33; qcov=0.461; evalue=6.26e-39; confidence=low
Rice	`Os10g0460733` - identity=43.6; qcov=0.387; evalue=1.35e-55; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005322

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788218.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057788218.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788218.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788218.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788218.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:26804057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B79,C43,C75
`Chr1:26804061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C75
`Chr1:26804074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,B99
`Chr1:26804912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C78,D10
`Chr1:26804919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B74,C21,C28
`Chr1:26804934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B48,C53,C78,D2
`Chr1:26804943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,D6
`Chr1:26804956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B92,D6
`Chr1:26804957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B48,C53,C78,D2,D9
`Chr1:26804961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:26804962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C18,C85
`Chr1:26804975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B54,B8,C20,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788218.1

605 aa

302

605

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

Plant_tran

PF01609 DDE_Tnp_1 372-539 aa PF13359 DDE_Tnp_4 379-539 aa PF04827 Plant_tran 485-542 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788218.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	372	539	5.7e-10	40.0	Transposase DDE domain
`XP_057788218.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	379	539	1.9e-22	80.3	DDE superfamily endonuclease
`XP_057788218.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	485	542	2.2e-06	28.2	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932235.1
ATGTCGACCGGTCATGCAAACTCCACCGAGGCTACCAACGCCGTCGCCGCCGCCGCTCCCGATATGATCCTCGCCAGTTTTGCTCTGCTCTGGAAGCTGATTCTGCTCTGCTATGGAAATACGCTCTGCTCTATAAGTCTGCTCTGCTCTGAACGTTCGCTCTACTCTCTTGGCTCTGTTCGGGCTGCATCAGCTCCTTCCGCCACCACCGCTGCTTCAACCGTGGCGTCTGCCACCTCTGCTGCTGGTGCCTCCACCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005322
ATGTCGACCGGTCATGCAAACTCCACCGAGGCTACCAACGCCGTCGCCGCCGCCGCTCCCGATATGATCCTCGCCAGTTTTGCTCTGCTCTGGAAGCTGATTCTGCTCTGCTATGGAAATACGCTCTGCTCTATAAGTCTGCTCTGCTCTGAACGTTCGCTCTACTCTCTTGGCTCTGTTCGGGCTGCATCAGCTCCTTCCGCCACCACCGCTGCTTCAACCGTGGCGTCTGCCACCTCTGCTGCTGGTGCCTCCACCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788218.1
MSTGHANSTEATNAVAAAAPDMILASFALLWKLILLCYGNTLCSISLLCSERSLYSLGSVRAASAPSATTAASTVASATSAAGASTFNGGSFGGPTPLPFMFGANQMTIGGESFVQGTVGQTPFGSTIGSTPSGSMGSMFGHTVGAFGTNVVGYGHMAGSMPTQPPRANATADKPPKFCGTDFKSWRQKMFFYLTTLGYVGYLTDNEPPTPAKNKTNFTVRAAYDAWHNDDFLCKNFLLGGLGDSLYKVYVDIKTSRACL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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