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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001368`

染色体: Chr01 坐标: 27037485-27040166 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001368`
名称	SmilChr01G001368
描述	uncharacterized SmilChr01G001368
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27037485 - 27040166 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005359`
GeneID	`131005359`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005359`
原始查询	`SmilChr01G001368`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0539700; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os12g0539700; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0539700` - identity=35.1; qcov=0.573; evalue=2.27e-83; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14214 (Helitron_like_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005359

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788274.1`
2	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057788274.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788274.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788274.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788274.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27037490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C71
`Chr1:27037490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:27037506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:27037510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,C19,C20,C6
`Chr1:27037523`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A11,B105,B109,B22,B23,B57,B71,B83,B84,B98,C32,C54,C59,C61,D5,D7
`Chr1:27037535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B62,C71
`Chr1:27037547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,C87
`Chr1:27037575`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A14,B105,B118,B16,B64,B69,C30
`Chr1:27037586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B44,B80
`Chr1:27037604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr1:27037608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr1:27037628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788274.1

815 aa

408

815

Helitron_like_N

PF14214 Helitron_like_N 285-467 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788274.1`	Pfam	`PF14214`	Helitron_like_N	Domain	285	467	7.7e-55	186.8	Helitron helicase-like domain at N-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932291.1
ATGTGGATTGAAGAAAATGTAGAACGTTCCAAGTCGTCCAACCCAATATTCTCACTATGTTGCAAGAAGGGTAAAGTCGTTCTTCCACCATTGCAAAAATCGCCTCAGCTGTTGAGCGACCTTCTGGAAAATAGGCACGAAAAGAGCAAGAAATTTATCGAGGATATTCGTGCTTATAATATGATGTTCTCATTCACCTCGATGGGTGGAAAATTGGATTATTCCATAAATCAAGGTGTCGGACCTTATACGTTTCGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005359
ATGTGGATTGAAGAAAATGTAGAACGTTCCAAGTCGTCCAACCCAATATTCTCACTATGTTGCAAGAAGGGTAAAGTCGTTCTTCCACCATTGCAAAAATCGCCTCAGCTGTTGAGCGACCTTCTGGAAAATAGGCACGAAAAGAGCAAGAAATTTATCGAGGATATTCGTGCTTATAATATGATGTTCTCATTCACCTCGATGGGTGGAAAATTGGATTATTCCATAAATCAAGGTGTCGGACCTTATACGTTTCGGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788274.1
MWIEENVERSKSSNPIFSLCCKKGKVVLPPLQKSPQLLSDLLENRHEKSKKFIEDIRAYNMMFSFTSMGGKLDYSINQGVGPYTFRLRGQNLHRIGSLLPMKKYNIEKNAVSKGKSNDFDDSIVNDLKQMIDESSPYAKIYRMAADHISRDNSVDVKLRLIGKRSRDGRTYNMPTTIEVAALIVGDFECMPDKRDVIVEKRSGELQRINEFHPSYLSLQYPLIFIYGEDGFYLDIPHNESQSSALSKKRKTKKNESQSSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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