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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001370`

染色体: Chr01 坐标: 27046240-27050291 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001370`
名称	SmilChr01G001370
描述	BTB/POZ and MATH domain-containing protein 4-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27046240 - 27050291 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017558`
GeneID	`131017558`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017558`
原始查询	`SmilChr01G001370`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BTB/POZ and MATH domain-containing protein 4-like
产物	BTB/POZ and MATH domain-containing protein 4-like
Arabidopsis	`AT3G03740` (BPM4) BTB-POZ and MATH domain 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821170] identity=75.4; qcov=0.965; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0792500` (OsMB5) - identity=75.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0016567 (protein ubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF00651 (BTB); PF00917 (MATH); PF22486 (MATH_2); PF24570 (BACK_BPM_SPOP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017558

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802342.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057802342.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057802342.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802342.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802342.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27046590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:27046659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr1:27048607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:27049905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:27049927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B122,B66,C25,C50
`Chr1:27049936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C60
`Chr1:27049936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802342.1

400 aa

200

400

MATH_2

MATH

BTB

BACK_BPM_SPOP

PF22486 MATH_2 29-160 aa PF00917 MATH 48-160 aa PF00651 BTB 188-304 aa PF24570 BACK_BPM_SPOP 309-361 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802342.1`	Pfam	`PF22486`	MATH_2	Domain	29	160	4.7e-32	111.8	MATH domain
`XP_057802342.1`	Pfam	`PF00917`	MATH	Domain	48	160	0.00029	21.8	MATH domain
`XP_057802342.1`	Pfam	`PF00651`	BTB	Domain	188	304	4.3e-24	85.5	BTB/POZ domain
`XP_057802342.1`	Pfam	`PF24570`	BACK_BPM_SPOP	Domain	309	361	2.5e-16	60.3	BPM/SPOP, BACK domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946359.1
ATAAAAATTTTCATTATTTATTACAAGAAGCAAAATTGGCAAAATATGTAGGCCAAAACGGTTATAACTAAAACGGTAAAAAAAAAGGAGCAATTACCGAGAGGGGCACAACTGTAACTATTTTGATTTTTGAATTAAAAATACAGCAAGTGCAGTGAAAGCCAGAAAGCCTCCTTGAATCGCGTCGTCTCCACCAAATTTCCCTAAATTGAACTCCAAAAAACCCTAATTAACTAACTTTCCCTCTCCTTCTCACCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017558
ATGTCTGAGACGCCGGAGACAGCCCCGAACCTGCTGATTTCGCCGACTAGCTCACGCTCCGTCACCGAGACGATAAACGGCTCGCACCGCTTTGTGATCCAGGGCTACTCCATGGCCAAAGGAATGGGCGTCGGCAAGCACATCGCCAGCGATGATTTCACCGTCGGAGGCTATAAATGGGCGATTTACTTTTACCCCGACGGTAAAAACCCCGAGGACAATTCGACTTACGTCTCGGTTTTCATCGCGCTGGCCAGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802342.1
MSETPETAPNLLISPTSSRSVTETINGSHRFVIQGYSMAKGMGVGKHIASDDFTVGGYKWAIYFYPDGKNPEDNSTYVSVFIALASEGTDVRALFELTLVDQSGKGKHKVHSHFDRSLESGPYTLKYRGSMWGYKRFFRRAMLETSDYLKDDCLKINCTVGVVVSAIDCSRLHPIQVPDSDIGSDFGMLLENMEGSDVTFNVSGEKFHAHKLILAARSPVFCSELFEELDSNGQDITVSDMEPKVFKAMLHFVYRDALDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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