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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001372`

染色体: Chr01 坐标: 27057733-27059408 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001372`
名称	SmilChr01G001372
描述	omega-hydroxypalmitate O-feruloyl transferase
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27057733 - 27059408 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017574`
GeneID	`131017574`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017574`
原始查询	`SmilChr01G001372`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	omega-hydroxypalmitate O-feruloyl transferase
产物	omega-hydroxypalmitate O-feruloyl transferase
Arabidopsis	`AT1G03390` (AT1G03390) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838725] identity=62; qcov=0.946; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0507200` - identity=38.4; qcov=0.953; evalue=1.14e-76; confidence=medium
GO	GO:0016747 (acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups)
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017574

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057802364.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057802364.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057802364.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802364.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802364.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27058115`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B14
`Chr1:27058115`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B14
`Chr1:27058135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr1:27058197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B33,B56,B96,C76
`Chr1:27058556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B104,D11
`Chr1:27058657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr1:27058661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr1:27058667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:27058889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B72
`Chr1:27059015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B129,C31,C57
`Chr1:27059105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B14
`Chr1:27059105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802364.1

448 aa

224

448

Transferase

PF02458 Transferase 27-443 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802364.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	27	443	6.3e-71	240.0	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946381.1
AGTGATTTTTGTATCTGCACATGAACTGATCTTCACCTACTAAGGCAGAAAGCTTCAATATGTTGTGCCAACAACTTTCTACCAAATGGATAGCTGACATCTTTGATTATTTGAGGCTGAATTTGGTGCTAGATCGATCTTCCCACCAGGATACTACTCTTTACCTCTCCAATCTTGATGACATGATTGGGGTGCGCATCTTCACTCCGACGGTCTACTTCTATCAGTCACAGGGCGACGAACCTATTTCTCAGATACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017574
ATGTTGTGCCAACAACTTTCTACCAAATGGATAGCTGACATCTTTGATTATTTGAGGCTGAATTTGGTGCTAGATCGATCTTCCCACCAGGATACTACTCTTTACCTCTCCAATCTTGATGACATGATTGGGGTGCGCATCTTCACTCCGACGGTCTACTTCTATCAGTCACAGGGCGACGAACCTATTTCTCAGATACTCAGGGACGCGCTGACGAGAGTCCTAGTGCCTTACTATCCTTTCACAGGTAGACTGAGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802364.1
MLCQQLSTKWIADIFDYLRLNLVLDRSSHQDTTLYLSNLDDMIGVRIFTPTVYFYQSQGDEPISQILRDALTRVLVPYYPFTGRLRETENGKLEIFFGPNQGALLVEAHSDVLLADLGDLSVPNPAWMNLIYRFPNEEQYKVVNMPLVIAQVTKFICGGFSLGLRICHCLCDGLGAMQFLNAWAETAKAGSLVVNPKPCWDREFFLPRDPPKIQFSHTEFKRIDDGSTLTKQLWQGKPVQKCYRMSREFQARLKRLAQAG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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