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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001376`

染色体: Chr01 坐标: 27119686-27126433 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001376`
名称	SmilChr01G001376
描述	nitrate regulatory gene2 protein-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27119686 - 27126433 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017612`
GeneID	`131017612`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017612`
原始查询	`SmilChr01G001376`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nitrate regulatory gene2 protein-like
产物	nitrate regulatory gene2 protein-like
Arabidopsis	`AT2G27090` (AT2G27090) bZIP transcription factor (DUF630 and DUF632) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817251] identity=50; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0321500` - identity=37.9; qcov=1.11; evalue=1.84e-150; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04782 (DUF632); PF04783 (DUF630)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017612

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802414.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802414.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802414.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802414.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802414.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27121891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr1:27121932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B29
`Chr1:27122063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B139,B90,B92,D6
`Chr1:27122167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C23,C8
`Chr1:27122298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr1:27122566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C46,C49,C7
`Chr1:27122575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B12,B124,C52
`Chr1:27122615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B131
`Chr1:27122722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr1:27123952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:27125218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A1,A16,A18,A21,A23,B108,B12,B124,B128,B29,B57,B73,B79,B98,C23,C36,C46,C49,C52,C7,C8
`Chr1:27125257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802414.1

771 aa

386

771

DUF630

DUF632

PF04783 DUF630 1-57 aa PF04782 DUF632 356-695 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802414.1`	Pfam	`PF04783`	DUF630	Family	1	57	1.3e-21	77.2	Protein of unknown function (DUF630)
`XP_057802414.1`	Pfam	`PF04782`	DUF632	Family	356	695	6.7e-104	348.3	Protein of unknown function (DUF632)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946431.1
GAAGAAATCCAGCTCTTAAAATGTTAAAAGCGACGCCCTCATTTCCATCCCAATCCCAAACCCAAATCCCAATGTCGTCTTTTTCACGTAGAGCATAAATTAAAGAAAAGCAGAGCTTTCATCCAACATAAATGTTTAGAACATCGCGACGAATCCAGATTAAACTTTTACTAAGAACAATATTATTCCATTTGCTTTTTCTAAGTCAGCGGGTCCCCACATCTCCTCCTCCCTTTTGATTACCATTGCATGCAAACTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017612
ATGGGAGCTTCAAATTCTAGATTAGAAGAAGACAAGAGTCTGCAGCTATGCCGGGCAAGAAAGAAATTCATCAAACAGGCACTTAATGGCAGGTGTTCTCTTGCAGCAGCTCATATTTCATATATAGAGGAACTGAAAATTGTAGGAGCGGCTTTAAGGAGATTTGTGGAATTTGATGCTCAAGTTGAGCCTTTAGCACATTCTTCGAGAAGTGCAACTCCAGAACCCCATTCTTTGAAGTCTGTCTCCCGGTTATCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802414.1
MGASNSRLEEDKSLQLCRARKKFIKQALNGRCSLAAAHISYIEELKIVGAALRRFVEFDAQVEPLAHSSRSATPEPHSLKSVSRLSFSSRSLSQNVDAIANLSPPSSTPVSTQFHSHHMKFRGTFSTKVEEKPPVPFAVSVSSTTPPTVTPRSTEAPEPSPFETAVTPENSPWDYFGLFHPIDQHFPTQAGRGFDQGSENSDEISHARVVAGAREIDNMEDKLSSDGIEDSQISDDEFDEPSTATLVRSFKNVNRSIENL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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