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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001382`

染色体: Chr01 坐标: 27230601-27231490 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001382`
名称	SmilChr01G001382
描述	uncharacterized SmilChr01G001382
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27230601 - 27231490 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005403`
GeneID	`131005403`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005403`
原始查询	`SmilChr01G001382`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RPA1C; symbol=RPA1C; hit=Os05g0111000; species=rice; confidence=weak
产物	RPA1C; symbol=RPA1C; hit=Os05g0111000; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os05g0111000` (RPA1C) - identity=44.1; qcov=0.246; evalue=1.38e-06; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005403

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057788363.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057788363.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057788363.1`
4	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057788363.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788363.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27230655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B119,C47,C51
`Chr1:27230722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B134,B65
`Chr1:27230730`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B17,B25,C45
`Chr1:27230730`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B17,B25,C45
`Chr1:27230747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:27230757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B42,B43
`Chr1:27230771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A11,A15,B1,B133,B137,B24,B32,B50,B86,C25,C34,C63
`Chr1:27230784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr1:27230823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr1:27230834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,D7
`Chr1:27230848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B7,B96
`Chr1:27230892`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B33

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932380.1
ATGGCTGGAGAAAGAGGAAGAGGACCTAATCCTGAAGAACATGTACCACGAGTTATACCAGAACATAGTGTGGAAGAGAGGTTTCGCAAGCATAATCTACCAACTTTTGATGGCTTTGGTGATCCTCTGGATGCCGAGAGATGGGAGCTACTGAAAGGATACTCAACCATGTTGGCTGTGGGGATAGGGAGAAACTCACATGCGCAATTTTCCAACTCTTTGATGAGGCCGAATTTTGGTGCGAATCGATGCTATAGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005403
ATGGCTGGAGAAAGAGGAAGAGGACCTAATCCTGAAGAACATGTACCACGAGTTATACCAGAACATAGTGTGGAAGAGAGGTTTCGCAAGCATAATCTACCAACTTTTGATGGCTTTGGTGATCCTCTGGATGCCGAGAGATGGGAGCTACTGAAAGGATACTCAACCATGTTGGCTGTGGGGATAGGGAGAAACTCACATGCGCAATTTTCCAACTCTTTGATGAGGCCGAATTTTGGTGCGAATCGATGCTATAGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788363.1
MAGERGRGPNPEEHVPRVIPEHSVEERFRKHNLPTFDGFGDPLDAERWELLKGYSTMLAVGIGRNSHAQFSNSLMRPNFGANRCYRKKKQDEFWNLRQGNMTVTEYDRMFNQLSRYAPHLVDTDEKCAEKALNIEAILPKEKENVSTQAPTQNYGKIKRKWEGGNEGNPGKMKQPWRGTQQQQGQAEGKTSCPTCQKNHYGECKIGSNDCFRCKQPGNFARDCPNNNGNMGMSQPQNLAP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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