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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001392`

染色体: Chr01 坐标: 27372506-27375203 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001392`
名称	SmilChr01G001392
描述	clathrin interactor EPSIN 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27372506 - 27375203 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005407`
GeneID	`131005407`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005407`
原始查询	`SmilChr01G001392`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	clathrin interactor EPSIN 1-like
产物	clathrin interactor EPSIN 1-like
Arabidopsis	`AT5G11710` (AT5G11710) ENTH/VHS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831043] identity=83.1; qcov=0.635; evalue=1.65e-96; confidence=high
Rice	`Os04g0599900` - identity=76.2; qcov=0.635; evalue=1.21e-86; confidence=high
GO	GO:0005543 (phospholipid binding); GO:0005768 (endosome); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006897 (endocytosis); GO:0030125 (clathrin vesicle coat); GO:0030276 (clathrin binding)
KEGG	-
Pfam	PF01417 (ENTH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005407

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057788377.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057788377.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788377.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788377.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788377.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27372562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B9,B95,C9
`Chr1:27372583`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B111,B52
`Chr1:27372698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	B120,B33,B34,B74,C14,C20,C32,C40,C45,C60,C68,C72
`Chr1:27372751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr1:27372752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr1:27372784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B29,C35
`Chr1:27373025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B99,D11
`Chr1:27373032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:27373181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B50,B94
`Chr1:27373183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr1:27373210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:27373221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B24,B48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788377.1

252 aa

126

252

ENTH

PF01417 ENTH 27-147 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788377.1`	Pfam	`PF01417`	ENTH	Repeat	27	147	3.9e-43	147.1	ENTH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932394.1
ACATATCTTATCAAATTGAAGAATTCGATCTGTATATCTCATCTTCGGGCAGATCCAGCCATGGATTTCATGAAGGTTTTTGATCAAACTGTCCGTGAAATAAAGAGGGAGGTGAATCTGAAGGTGTTGAAGGTTCCAGAGATAGAACAAAAGGTTCTGGATGCTACGGATGATGAACCTTGGGGTCCTCATGGCACAGTGTTGTCAGAAATAGCACAAGCTACAAAGAAATTCACCGAATGTCAGATGGTAATGAATGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005407
ATGGATTTCATGAAGGTTTTTGATCAAACTGTCCGTGAAATAAAGAGGGAGGTGAATCTGAAGGTGTTGAAGGTTCCAGAGATAGAACAAAAGGTTCTGGATGCTACGGATGATGAACCTTGGGGTCCTCATGGCACAGTGTTGTCAGAAATAGCACAAGCTACAAAGAAATTCACCGAATGTCAGATGGTAATGAATGTCCTCTGGACAAGATTGACTGAGACTGGCAAGAATTGGCGTTTTGTCTACAAGTCGTTGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788377.1
MDFMKVFDQTVREIKREVNLKVLKVPEIEQKVLDATDDEPWGPHGTVLSEIAQATKKFTECQMVMNVLWTRLTETGKNWRFVYKSLTVIEYLVGHGSERAVDDIIEHTFKISSLASFEYVEPSGKDVGINVRKKAEAIVALLNNKEKMKEVRNKAAANRDNCSETMKCLVDQGDFMKSVIVSYSPILSSLKPFVLSGRTLSARKWHATFSPEGYLDIGKILNRVQRGITFMRKKDFRKEQLVLEDLVLEYIV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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