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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001412`

染色体: Chr01 坐标: 27718103-27718804 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001412`
名称	SmilChr01G001412
描述	agamous-like MADS-box protein AGL62
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27718103 - 27718804 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005462`
GeneID	`131005462`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005462`
原始查询	`SmilChr01G001412`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	agamous-like MADS-box protein AGL62
产物	agamous-like MADS-box protein AGL62
Arabidopsis	`AT5G60440` (AGL62) AGAMOUS-like 62 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836165] identity=47; qcov=0.727; evalue=8.16e-41; confidence=medium
Rice	`Os12g0407000` (OsMADS73) - identity=39.5; qcov=0.745; evalue=1.51e-30; confidence=medium
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00319 (SRF-TF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005462

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788448.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788448.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788448.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788448.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788448.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27718131`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C62
`Chr1:27718131`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C62
`Chr1:27718135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C69
`Chr1:27718324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,C11,C69
`Chr1:27718363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,C11,C69
`Chr1:27718378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:27718387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B104,B23,B93,C58
`Chr1:27718411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr1:27718547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr1:27718586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C1
`Chr1:27718701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr1:27718758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788448.1

231 aa

116

231

SRF-TF

PF00319 SRF-TF 25-72 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788448.1`	Pfam	`PF00319`	SRF-TF	Domain	25	72	7.1e-21	74.1	SRF-type transcription factor (DNA-binding and dimerisation domain)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932465.1
ATGGTGATCTTGAGAGAGAGCGGCGGCGCGGGGAAGAAGACGACGCAGGGGAGGAAGAAGATCGAGATCAAGAAGATCGAGAACTTGAGCAACCGGCAAGTCACCTTCTCGAAGCGGCGCGTGGGGTTGTTCAAGAAGGCCAGCGAGCTCTGCATTTTGAGCGGCGCCGAGATAGCCATCATCGTCCACTCCCTCGGAAAGCGCGTCTTCTCCTTCGGCCACCCCTCCACCGACGCCGTCGTCGACCGCTTCCTCGGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005462
ATGGTGATCTTGAGAGAGAGCGGCGGCGCGGGGAAGAAGACGACGCAGGGGAGGAAGAAGATCGAGATCAAGAAGATCGAGAACTTGAGCAACCGGCAAGTCACCTTCTCGAAGCGGCGCGTGGGGTTGTTCAAGAAGGCCAGCGAGCTCTGCATTTTGAGCGGCGCCGAGATAGCCATCATCGTCCACTCCCTCGGAAAGCGCGTCTTCTCCTTCGGCCACCCCTCCACCGACGCCGTCGTCGACCGCTTCCTCGGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788448.1
MVILRESGGAGKKTTQGRKKIEIKKIENLSNRQVTFSKRRVGLFKKASELCILSGAEIAIIVHSLGKRVFSFGHPSTDAVVDRFLGGGDERDGAVAATAVNTRDFNRHYSDVSKELEVEKKRRDMIEEQKKAEGHGGGDGFWWNQDVDEMELDELEQFAMALEELKKNTDLRANDLMISHSLPPVVAAASLTMQIPSAAAFEEAPPLFGGQSNFDFENCIVPNQGFGHGQF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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