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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001417`

染色体: Chr01 坐标: 27755515-27756043 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001417`
名称	SmilChr01G001417
描述	basic form of pathogenesis-related protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27755515 - 27756043 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017962`
GeneID	`131017962`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017962`
原始查询	`SmilChr01G001417`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	basic form of pathogenesis-related protein 1-like
产物	basic form of pathogenesis-related protein 1-like
Arabidopsis	`AT4G33720` (AT4G33720) CAP (Cysteine-rich secretory proteins, Antigen 5, and Pathosis-related 1 protein) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829514] identity=49.4; qcov=0.994; evalue=2.23e-51; confidence=high
Rice	`Os01g0382400` (OsPR1#012) - identity=46.1; qcov=0.981; evalue=6.22e-45; confidence=medium
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0005615 (GO:0005615)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00188 (CAP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017962

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057802705.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057802705.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802705.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802705.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802705.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27755541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:27755598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:27755652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr1:27755658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C27
`Chr1:27755673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C37,C69
`Chr1:27755681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr1:27755693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,D8
`Chr1:27755740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B63,C13,C65
`Chr1:27755751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B29,C27
`Chr1:27755752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:27755757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B9,C3,C43,C46
`Chr1:27755798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,B86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802705.1

159 aa

159

CAP

PF00188 CAP 29-147 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802705.1`	Pfam	`PF00188`	CAP	Domain	29	147	5.3e-21	76.4	Cysteine-rich secretory protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946722.1
GTGAAAAGAATGCCATATACTGAAAGAATAGGAAGATGATGATGAGTAAAAATGTGATTGTGGTGTTGGTATGGGTGATGATGGGATTGGCGGATGCCCAAAATCGGCCGAAAGACTACGTGAATGCACACAACGTGGCCCGAGCGACGGTGGGTGTGGGACCCCTTGTTTGGAACGAGACGCTGACTCAGTACGCCAGGGAATATGCCCACGTGCGCTCTGCGGATTGCGCAATGCAGCATTCCGATGGGCCCTACGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017962
ATGATGATGAGTAAAAATGTGATTGTGGTGTTGGTATGGGTGATGATGGGATTGGCGGATGCCCAAAATCGGCCGAAAGACTACGTGAATGCACACAACGTGGCCCGAGCGACGGTGGGTGTGGGACCCCTTGTTTGGAACGAGACGCTGACTCAGTACGCCAGGGAATATGCCCACGTGCGCTCTGCGGATTGCGCAATGCAGCATTCCGATGGGCCCTACGGCGAGAACCTAGCGGCGGGGAGCTGGAACGTCAGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802705.1
MMMSKNVIVVLVWVMMGLADAQNRPKDYVNAHNVARATVGVGPLVWNETLTQYAREYAHVRSADCAMQHSDGPYGENLAAGSWNVSAKEAVDMWLDEKPLYDENTGDCIGGGLDCRHYTQVMWGDSKCLGCAHTHCPDGWTFITCNYDPPGNYIGERPY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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