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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001422`

染色体: Chr01 坐标: 27831177-27835759 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001422`
名称	SmilChr01G001422
描述	DUF21 domain-containing protein At2g14520-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	27831177 - 27835759 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017879`
GeneID	`131017879`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017879`
原始查询	`SmilChr01G001422`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF21 domain-containing protein At2g14520-like
产物	DUF21 domain-containing protein At2g14520-like
Arabidopsis	`AT2G14520` (AT2G14520) CBS domain protein (DUF21) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815939] identity=77.3; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0125800` (OsCBSDUF3) - identity=57.8; qcov=1.01; evalue=2.4e-132; confidence=high
GO	GO:0010960 (magnesium ion homeostasis); GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle)
KEGG	-
Pfam	PF01595 (CNNM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017879

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057802599.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057802608.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802599.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802599.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802599.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:27831471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:27831497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr1:27831504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:27834473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr1:27834487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C37,C69
`Chr1:27834488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C27,C43
`Chr1:27834907`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C45
`Chr1:27834907`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C45
`Chr1:27834914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C11,C36,C37,C69
`Chr1:27835157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr1:27835230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802599.1

427 aa

214

427

CNNM

PF01595 CNNM 19-189 aa

XP_057802608.1

362 aa

181

362

CNNM

PF01595 CNNM 30-124 aa

XP_057802614.1

344 aa

172

344

CNNM

PF01595 CNNM 6-106 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802599.1`	Pfam	`PF01595`	CNNM	Domain	19	189	8.7e-36	124.0	Cyclin M transmembrane N-terminal domain
`XP_057802608.1`	Pfam	`PF01595`	CNNM	Domain	30	124	1.9e-18	67.5	Cyclin M transmembrane N-terminal domain
`XP_057802614.1`	Pfam	`PF01595`	CNNM	Domain	6	106	1.5e-18	67.8	Cyclin M transmembrane N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099918.1
AAAAAAAAACACAACTATAAATACCATTAGAAGGCATTTGAGCAGCAGCAGTAGCATCACGCCCTTCCCTTGGACAAAAGCACAACTATAAATACCATTACTCTCCCGCAAAATCCTGCACTTGTTCATATTCTGCCTGCCACATATATAATTTGTTCAGAATCAGGAGGCGCAAATTCGGCTGAGAAGTTCGCCGGTGGCGGCGAAGCGGTGGTGTGACTGGTTGTATGGCGGTGGAGTACCGATGTTGCGAGGCGGGG...

XM_057946616.1
ATAAGGATGCAGTAAATAGTTGTATACTTTCTCTCTACCGTTTCTAGATTAGACAAAAAAAAAAAAAAAAACACAACTATAAATACCATTAGAAGGCATTTGAGCAGCAGCAGTAGCATCACGCCCTTCCCTTGGACAAAAGCACAACTATAAATACCATTACTCTCCCGCAAAATCCTGCACTTGTTCATATTCTGCCTGCCACATATATAATTTGTTCAGAATCAGGAGGCGCAAATTCGGCTGAGAAGTTCGCCGGT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131017879
ATGGCGGTGGAGTACCGATGTTGCGAGGCGGGGTTCTTCATTCGCATTGCGGTTGTGGCTTTTCTCGTGCTGTTTGCTGGCCTCATGTCCGGCCTCACTTTGGGCCTCATGTCTCTCAGCTTAGTCGACCTTGAAGTTCTCGCTAAGTCCGGCACACCCACGGATCGAAAGCATGCTGAAAAGATATTGCCCGTTGTTAAGAATCAGCATTTGTTGCTTTGCACACTGCTTATCTGCAATGCTGCTGCTATGGAGGCTCT...

LOC131017879
ATGCTGAAAAGATATTGCCCGTTGTTAAGAATCAGCATTTGTTGCTTTGCACACTGCTTATCTGCAATGCTGCTGCTATGGAGTCTCATCTCAGCTTGGGGGGCAATCCTGATATCTGTGACATTGATACTTCTGTTTGGTGAGATCATCCCACAGTCTGTTTGTTCCAGACATGGGTTAGCTATTGGTGCGACTGTGGCCCCAGTGGTTCGTGTTCTTGTCTGGATCTGTTTTCCTGTTGCATATCCTATAAGCAAGTT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057802599.1
MAVEYRCCEAGFFIRIAVVAFLVLFAGLMSGLTLGLMSLSLVDLEVLAKSGTPTDRKHAEKILPVVKNQHLLLCTLLICNAAAMEALPIFLDSLISAWGAILISVTLILLFGEIIPQSVCSRHGLAIGATVAPVVRVLVWICFPVAYPISKLLDSLLGHGHRALFRRAELKTLVTLHGNEAGKGGELTHDETTIIAGALELGEKTASDAMTPISEIFAIDINDKLDRVLVNLILEKGHSRIPVYYEQPTNIIGLILAKNL...

XP_057802608.1
MLKRYCPLLRISICCFAHCLSAMLLLWSLISAWGAILISVTLILLFGEIIPQSVCSRHGLAIGATVAPVVRVLVWICFPVAYPISKLLDSLLGHGHRALFRRAELKTLVTLHGNEAGKGGELTHDETTIIAGALELGEKTASDAMTPISEIFAIDINDKLDRVLVNLILEKGHSRIPVYYEQPTNIIGLILAKNLLTIHPEDEVPVKSVTIRRIPRVPETMPLYDILNEFQKGHSHMAVVVRQCDKVADKPRSTDVAGDA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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