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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001434`

染色体: Chr01 坐标: 28010553-28011194 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001434`
名称	SmilChr01G001434
描述	uncharacterized SmilChr01G001434
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	28010553 - 28011194 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005517`
GeneID	`131005517`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005517`
原始查询	`SmilChr01G001434`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutathione S-transferase THETA 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834125]; symbol=GSTT2; hit=AT5G41240; species=arabidopsis; confidence=low
产物	glutathione S-transferase THETA 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834125]; symbol=GSTT2; hit=AT5G41240; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G41240` (GSTT2) glutathione S-transferase THETA 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834125] identity=25.7; qcov=0.676; evalue=9.6e-06; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14303 (NAM-associated)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005517

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788513.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788513.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788513.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788513.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788513.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:28010560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C44
`Chr1:28010584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B91,C12
`Chr1:28010598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr1:28010603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B54
`Chr1:28010608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr1:28010640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C12
`Chr1:28010641`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	32	A2,A3,B11,B112,B127,B128,B135,B139,B140,B35,B42,B45,B49,B64,B66,B77,B79,B98,C1,C13,C19,C35,C36,C52,C59,C60,C67,C72,C82,C87,D4,D5
`Chr1:28010664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B23,B32
`Chr1:28010688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B136,C27,C29,C43
`Chr1:28010698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B23,B54,C46,C49
`Chr1:28010707`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B18,B86,C74
`Chr1:28010707`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B18,B86,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788513.1

213 aa

106

213

NAM-associated

PF14303 NAM-associated 59-201 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788513.1`	Pfam	`PF14303`	NAM-associated	Family	59	201	2.7e-07	32.3	No apical meristem-associated C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932530.1
ATGAAAGGTCGCTGGAAACGTCTTAACGAAAATGGAAACAAATGGGTTGCTGCTTGCAGGGAAGCAAATGCTCGAAGAAGGAGTGGCATGAGCGACAACGATGTTGAGAAAGAAGTTCATTCCATTTACGAAGCAGGTAGAAATAAGTTTCTAGACTTTGTTGTATTTAATGAAGTTATGAGTAAACATCCCAAGTGGAATGTTCATGATATCACCCATGTTTTTCGTCGTCAAAGTGAAGATGTTGATGACCAGGAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005517
ATGAAAGGTCGCTGGAAACGTCTTAACGAAAATGGAAACAAATGGGTTGCTGCTTGCAGGGAAGCAAATGCTCGAAGAAGGAGTGGCATGAGCGACAACGATGTTGAGAAAGAAGTTCATTCCATTTACGAAGCAGGTAGAAATAAGTTTCTAGACTTTGTTGTATTTAATGAAGTTATGAGTAAACATCCCAAGTGGAATGTTCATGATATCACCCATGTTTTTCGTCGTCAAAGTGAAGATGTTGATGACCAGGAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788513.1
MKGRWKRLNENGNKWVAACREANARRRSGMSDNDVEKEVHSIYEAGRNKFLDFVVFNEVMSKHPKWNVHDITHVFRRQSEDVDDQESGGSSKRSKTSEDGGFSIPSNPETPTSEQSTATCPIGRDKAKRRKGKVSQSESTHESAVAAELRAMRLTRDAEAELIKTRIELEREKLQRNAMKMKEKMLLQLLVKDHLSLEDEEMKRQLTKIVFGE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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