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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001442`

染色体: Chr01 坐标: 28102489-28108996 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001442`
名称	SmilChr01G001442
描述	nucleolar complex-associated protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	28102489 - 28108996 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018130`
GeneID	`131018130`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018130`
原始查询	`SmilChr01G001442`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nucleolar complex-associated protein 3-like
产物	nucleolar complex-associated protein 3-like
Arabidopsis	`AT1G79150` (AT1G79150) binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844256] identity=57.3; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0498500` (NOC3) - identity=50.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003682 (chromatin binding); GO:0005730 (nucleolus); GO:0006270 (DNA replication initiation)
KEGG	-
Pfam	PF03914 (CBF); PF07540 (NOC3p)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018130

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802838.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057802838.1`
3	Nucleolus rim	Nucleolus rim	1.00000	`XP_057802838.1`
4	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.40000	`XP_057802838.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057802838.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:28102715`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B103
`Chr1:28102715`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B103
`Chr1:28102781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B122,B33,C61,C83
`Chr1:28102873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B29
`Chr1:28102956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B29
`Chr1:28103333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr1:28103355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:28104351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr1:28104366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:28105463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C56,C60
`Chr1:28106581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr1:28106882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802838.1

817 aa

408

817

NOC3p

CBF

PF07540 NOC3p 184-274 aa PF03914 CBF 542-697 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802838.1`	Pfam	`PF07540`	NOC3p	Family	184	274	8.6e-28	97.3	Nucleolar complex-associated protein
`XP_057802838.1`	Pfam	`PF03914`	CBF	Repeat	542	697	2.8e-28	99.7	CBF/Mak21 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946855.1
TTTCCCTCTTCTCCCTACAAACAGCTTGGTCCCCAATCCCCATTCCCCAGTTGCTGTTCACGTAGCCTCTCTCACACTTGACACTACTCCCCCTGCTGCGATTCACCGTCGGACCTAAGCCGGCGCCGCCCCCATCTCTCCCGTGTCCCGCCCATCCCGAACCCGACACCGCAGCCGCAGCAGACATCAGTCCCGGGTCCGGGTACCTGATTTTTTCGGCAAAATGGGGAAGAAAAAACAGAAGATAATACTGCCACCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018130
ATGGGGAAGAAAAAACAGAAGATAATACTGCCACCGGATCTTCCCCCTGAAGTCCCTGATGAAGAAATTGAAGTTTCTGATGAGGATTTGCAGTTTGTCAACCAGCATTCGGATTATGCTCATTTCATTTCCAAAATTGACACACCTTCCCTCACCAAGCATGTTAGTCGAGTGGCTGATGCGAATGAAGGTGCTTTAGAAATATTATATGAGAAGAAGTTGAGAAAGAAATTGGAAAATAAAGAGTCAGAGGAGAATAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802838.1
MGKKKQKIILPPDLPPEVPDEEIEVSDEDLQFVNQHSDYAHFISKIDTPSLTKHVSRVADANEGALEILYEKKLRKKLENKESEENTLEVDPIDALPLKTPDGQLYYRRVLKEPKEAEDESKVGESIKDPALVKSTKAEKRLKLKKLRKEAKKQAKEEVQQTPQAEVLDEVKKDLTAEEANEKKKYKFAELGTTLLADPESNIKLIKEMLEISKDGDSTIVILGLKSLLAVFKDIIPGYRIRLPTEKEQEMKVSKDVKKM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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