当前解析结果
SmilChr01G001460| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001460 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001460 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001460 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 28360104 - 28362423 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018315 |
|---|---|
| GeneID | 131018315 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018315 |
| 原始查询 | SmilChr01G001460 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | tropomyosin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836539]; symbol=AT5G64180; hit=AT5G64180; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | tropomyosin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836539]; symbol=AT5G64180; hit=AT5G64180; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G64180 (AT5G64180)tropomyosin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836539] identity=76.3; qcov=0.732; evalue=1.76e-37; confidence=medium |
| Rice | Os12g0502100 (SIP15)- identity=71.4; qcov=0.717; evalue=9.94e-25; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018315 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.60000 | XP_057803029.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057803023.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057803023.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057803023.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803029.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:28360363 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C45,C60 |
Chr1:28361031 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B63 |
Chr1:28361094 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A24,B27 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。