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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001471`

染色体: Chr01 坐标: 28485924-28487495 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001471`
名称	SmilChr01G001471
描述	uncharacterized SmilChr01G001471
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	28485924 - 28487495 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018381`
GeneID	`131018381`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018381`
原始查询	`SmilChr01G001471`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018381

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803094.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057803094.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057803094.1`
4	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057803094.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057803094.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:28485981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C60,C77
`Chr1:28485981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,C77
`Chr1:28485999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr1:28486001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B40,B69,C77,C86
`Chr1:28486131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:28486137`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	C16,C50,C87
`Chr1:28486137`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	C16,C50,C87
`Chr1:28486160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr1:28486162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B57,B98,C15
`Chr1:28486171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B6,C11,C42,C84
`Chr1:28486179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A7,A8
`Chr1:28486179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,A8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803094.1

428 aa

214

428

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 277-415 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803094.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	277	415	2.5e-06	28.2	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947111.1
CGCCATCCAGAGACCCAGGATTACAACGAGCAGTGGCGGGCCATGAATCAGTCTGTTCAGGGCGACTACACACCGGCGGAGCAGACTTTTGACTGGTCGACCCAGGTCTACCCTCATTGGTCTTCCCCATTCCTGAAGCCGCAGTATAGAACAGAGACCCCGATATTCTTTGCTGAACCGCTCACTTCTATTGCACCACATGAGTGGGGACAGTCCAGTTCGGCAGGACAGGCTCAGACGGAGGAGCCTGAGCCACAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018381
ATGAATCAGTCTGTTCAGGGCGACTACACACCGGCGGAGCAGACTTTTGACTGGTCGACCCAGGTCTACCCTCATTGGTCTTCCCCATTCCTGAAGCCGCAGTATAGAACAGAGACCCCGATATTCTTTGCTGAACCGCTCACTTCTATTGCACCACATGAGTGGGGACAGTCCAGTTCGGCAGGACAGGCTCAGACGGAGGAGCCTGAGCCACAGGCAGAGCAGCCACAGGTACTGCTGCTGCAGCACCTAGAGCAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803094.1
MNQSVQGDYTPAEQTFDWSTQVYPHWSSPFLKPQYRTETPIFFAEPLTSIAPHEWGQSSSAGQAQTEEPEPQAEQPQVLLLQHLEQPPAEQPPAQPPRRSQRVRRPSNNQRSPWVNSQMPRPVTQVCSDHYEKWMARCREGRGREIYVKASGGLREYDDFARVDNVSQEFTTGDIDLYFFSLRNRLRASADLLDDVDMKNTIILDTDWFIYLQGEWDALLEKWARSEFTPEEYHILTHGAVADGWQPRIDWLCQIRGKAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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