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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001473`

染色体: Chr01 坐标: 28492463-28493845 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001473`
名称	SmilChr01G001473
描述	uncharacterized SmilChr01G001473
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	28492463 - 28493845 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005672`
GeneID	`131005672`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005672`
原始查询	`SmilChr01G001473`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0357300; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os04g0357300; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G51700` (AT3G51700) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824333] identity=42.8; qcov=0.63; evalue=1.22e-71; confidence=medium
Rice	`Os04g0357300` - identity=39.8; qcov=0.802; evalue=7.11e-85; confidence=medium
GO	GO:0000723 (telomere maintenance); GO:0003678 (DNA helicase activity); GO:0006281 (DNA repair)
KEGG	-
Pfam	PF05970 (PIF1); PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005672

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788687.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057788687.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057788687.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788687.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788687.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:28492480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C26,C39,C57
`Chr1:28492492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,C59
`Chr1:28492500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B130,C29,C59
`Chr1:28492515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B72,C68,C78
`Chr1:28492523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B1,B36
`Chr1:28492562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B38,B75,C16
`Chr1:28492599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B36,B42,B6,B7
`Chr1:28492605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B71,B96,C19,D11
`Chr1:28492629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B52,C1,D4
`Chr1:28492672`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C67
`Chr1:28492672`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C67
`Chr1:28492676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788687.1

460 aa

230

460

PIF1

Pif1_2B_dom

PF05970 PIF1 1-201 aa PF21530 Pif1_2B_dom 297-343 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788687.1`	Pfam	`PF05970`	PIF1	Family	1	201	9.9e-91	304.0	PIF1-like helicase
`XP_057788687.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	297	343	2.1e-23	82.5	DNA helicase Pif1, 2B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932704.1
ATGTTTTTCATATATGGGTATGGAGGTACGGGAAAAACATTCATATGGAACACTCTTTCAGCAGCTCTAAGGTCAAAGGGAGAAATTGTTTTAAATGTTGCTTCAAGTGGAATTGCGTCCCTGTTGTTGCCTGGTGGAAGAACAGCTCATTCACGATTCAAAATTCCCATAAATGTCAATGAGGATTCCATGTGCAACATCAATCAAGGTTCTCCACTTGCAGAATTGATTGTTAAGTGTAAGCTTATTATTTGGGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005672
ATGTTTTTCATATATGGGTATGGAGGTACGGGAAAAACATTCATATGGAACACTCTTTCAGCAGCTCTAAGGTCAAAGGGAGAAATTGTTTTAAATGTTGCTTCAAGTGGAATTGCGTCCCTGTTGTTGCCTGGTGGAAGAACAGCTCATTCACGATTCAAAATTCCCATAAATGTCAATGAGGATTCCATGTGCAACATCAATCAAGGTTCTCCACTTGCAGAATTGATTGTTAAGTGTAAGCTTATTATTTGGGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788687.1
MFFIYGYGGTGKTFIWNTLSAALRSKGEIVLNVASSGIASLLLPGGRTAHSRFKIPINVNEDSMCNINQGSPLAELIVKCKLIIWDEAPMMHKFCFEALDRSLRDIMRFVNPSSASTPFGGKTVVFGGDFRQILPVIPKGSRQDIVFATINSSYLWKYCKVLRLTKNMRLQNMGSSAEAVELEEFSKWIASIGDGTIGSANDGNVNIDIRTDFLIKWSGNPIEHIVNTIYPSDCSNNVDTSYLQERAILAPTLNAVEYVN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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