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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001474`

染色体: Chr01 坐标: 28508082-28509865 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001474`
名称	SmilChr01G001474
描述	non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 11-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	28508082 - 28509865 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018390`
GeneID	`131018390`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018390`
原始查询	`SmilChr01G001474`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 11-like
产物	non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 11-like
Arabidopsis	`AT5G64080` (XYP1) Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836529] identity=69.3; qcov=0.558; evalue=1.2e-46; confidence=medium
Rice	`Os03g0192600` (OsLTPG3) - identity=46.5; qcov=0.856; evalue=7.34e-33; confidence=medium
GO	GO:0006869 (lipid transport); GO:0008289 (lipid binding)
KEGG	-
Pfam	PF00234 (Tryp_alpha_amyl); PF14368 (LTP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018390

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057803101.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803101.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803101.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803101.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803101.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:28508372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr1:28508407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,C61
`Chr1:28508416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr1:28508453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B104,C45
`Chr1:28508552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C48
`Chr1:28508689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr1:28509505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B22,B63,C25,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803101.1

181 aa

181

LTP_2

Tryp_alpha_amyl

PF14368 LTP_2 20-113 aa PF00234 Tryp_alpha_amyl 35-113 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803101.1`	Pfam	`PF14368`	LTP_2	Family	20	113	1.8e-15	57.6	Probable lipid transfer
`XP_057803101.1`	Pfam	`PF00234`	Tryp_alpha_amyl	Domain	35	113	5.3e-13	49.7	Protease inhibitor/seed storage/LTP family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947118.1
ACTGATAATATCTGTATTTATTACTCTTAAGCGCGCTCTCTCTCTCTCTCTTCTTTCAAATTTTTGAACTAACGTCTCTTATAAAAACACCGAAATCATATCTGTAACAGAGGCATGTCATTCCACGTGTCCCACCCTTACCCCCACCCCCTTCTTATATAAGGGCACCTGCACAATTCATTCTCATTTCACCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTAAGCACAATCGCAATCAGCGCAAACGCACGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018390
ATGGCAGCGATGAGATCGAGAATGGCGGTTATCTGCACGGTCTGCGCCCTCCTAGCGGCGGTATGCTCGGCGGCGCGTTCTGCTCCGGCGCCGGCGGTGGACTGCTCGAGCCTGGTGCTGAACATGGCGGACTGCCTGACGTTCGTGACGGCGGGGAGCACGACGAAGAAGCCGGAGGGGACGTGCTGCTCGGGGCTTAAAACGGTGCTGAAAACCGACGCCGAATGCCTGTGCGAGGCCTTCCGGAACAGTGCGCAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803101.1
MAAMRSRMAVICTVCALLAAVCSAARSAPAPAVDCSSLVLNMADCLTFVTAGSTTKKPEGTCCSGLKTVLKTDAECLCEAFRNSAQLGVTLNITKAMSLPAACHVSAPSVSNCGLSIGTGAAPALSPLGVSPSSVAAPPSGSSGANEVSPAPTPAATQSAASPLAASVSLLLLAAASLTLF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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