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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001477`

染色体: Chr01 坐标: 28557908-28560722 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001477`
名称	SmilChr01G001477
描述	F-box/kelch-repeat protein At1g22040
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	28557908 - 28560722 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018418`
GeneID	`131018418`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018418`
原始查询	`SmilChr01G001477`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At1g22040
产物	F-box/kelch-repeat protein At1g22040
Arabidopsis	`AT1G22040` (AT1G22040) Galactose oxidase/kelch repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838809] identity=59.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0363600` (OsFbox547) - identity=57.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF01344 (Kelch_1); PF07646 (Kelch_2); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018418

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057803126.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057803126.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803126.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803126.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803126.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:28559094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr1:28559403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C18
`Chr1:28559546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,C32,C68
`Chr1:28559987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr1:28560029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803126.1

478 aa

239

478

F-box-like

F-box

Kelch_2

Kelch_1

PF12937 F-box-like 43-80 aa PF00646 F-box 43-83 aa PF07646 Kelch_2 170-214 aa PF01344 Kelch_1 170-215 aa PF01344 Kelch_1 218-266 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803126.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	43	80	1.2e-07	32.1	F-box-like
`XP_057803126.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	43	83	1.3e-09	38.3	F-box domain
`XP_057803126.1`	Pfam	`PF07646`	Kelch_2	Repeat	170	214	4.2e-13	49.2	Kelch motif
`XP_057803126.1`	Pfam	`PF01344`	Kelch_1	Repeat	170	215	1.7e-30	104.8	Kelch motif
`XP_057803126.1`	Pfam	`PF01344`	Kelch_1	Repeat	218	266	1.7e-30	104.8	Kelch motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947143.1
AAAAGAAAAGTAAAGTCACAAAAAGCTGTGGAAATCGTTGGATCCTTCGCTAAATTCCCAATTCATATGAAAAACGCACAGCCACGTTTTAATGCGCACCAATTTCGACTATTGTTCCTATATTCATTTCCGTTTCCTCTGTAGATTCTTGAATTGTAGAATCCTTACACCGAAAATGGATTTTCGGCAGAAAAGATAGCAGTCTAAAGCAGATTGAAGCAACCCTTTGTTTTTAAGTAGGAGGTAAAGGAGTTCTATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018418
ATGGGAGCTAGATTGAGTTCCAGTGGTCATAAACTGGGTTGCAGCGAGAATTTTGAGGCGTCTCAGAGTGAGGCATGTAAGAGACAAAGGACTTCTTCTTGCTTATGGGATGACAATCCGCGACTGATTCCCAGCCTTCCCGATGAGATATCAATTCAGATTCTTGCTAGACTCCCTAGAATTTCTCATTTCAATGCAAAGCTTGTTTCGAGAAGCTGGAAAGCTGCTATAACAAGTGGGGAAATTTTTAAATTGAGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803126.1
MGARLSSSGHKLGCSENFEASQSEACKRQRTSSCLWDDNPRLIPSLPDEISIQILARLPRISHFNAKLVSRSWKAAITSGEIFKLRKELGTTEEWLYVLTKIDGNKLLWHALDPVSQIWQRLPLMPTVVADEGMRWGLSGFRLWNMVGSSVIADAIRGLLGRKRALDQIPFCGCAIGAVDDCLYVLGGFSRALVMNNVWRYNPIVNAWSEATPMSIGRAYCKTGVLNNKLYVIGGVTRGRVALSPLQSAEVFDPCSGTWS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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