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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001479`

染色体: Chr01 坐标: 28570654-28571521 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001479`
名称	SmilChr01G001479
描述	aminotransferase ALD1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	28570654 - 28571521 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005692`
GeneID	`131005692`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005692`
原始查询	`SmilChr01G001479`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aminotransferase ALD1, chloroplastic-like
产物	aminotransferase ALD1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G13810` (ALD1) AGD2-like defense response protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815864] identity=65.3; qcov=0.935; evalue=1.11e-40; confidence=medium
Rice	`Os03g0195100` (OsALD1) - identity=62.5; qcov=0.889; evalue=8.68e-39; confidence=medium
GO	GO:0009507 (chloroplast); GO:0009862 (systemic acquired resistance, salicylic acid mediated signaling pathway); GO:0062034 (L-pipecolic acid biosynthetic process); GO:0062045 (L-lysine:pyruvate alpha-transaminase activity)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005692

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788709.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057788709.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788709.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788709.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788709.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:28570657`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B82,D11
`Chr1:28570657`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B82,D11
`Chr1:28570680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:28571120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B33,C32,C68
`Chr1:28571149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B35,B76,B78
`Chr1:28571172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:28571431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C79
`Chr1:28571449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B99,C44,C49
`Chr1:28571479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A18
`Chr1:28571479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932726.1
TTATTAGTAGTGACTCCCTTTTTTCCTTAACATTTTATGTTCCAATATGCATACAGCCTTTCAACACGTACAGGTTACAGAGGCTACGGAGCTGAGCAAGGAAGCAAGGATCTAAGAGAAGCCATAGCAGAGACATTTTACAAAGACATGGGTATACAAGGTGCTGAAGTGTTTGTATCCGATGGTGCACAATGTGATATTTCTCGCCTGCAGATGCTCTTTGGATCAAACATGTCCATCGCCGTTCAAGATCCAATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005692
ATGTTCCAATATGCATACAGCCTTTCAACACGTACAGGTTACAGAGGCTACGGAGCTGAGCAAGGAAGCAAGGATCTAAGAGAAGCCATAGCAGAGACATTTTACAAAGACATGGGTATACAAGGTGCTGAAGTGTTTGTATCCGATGGTGCACAATGTGATATTTCTCGCCTGCAGATGCTCTTTGGATCAAACATGTCCATCGCCGTTCAAGATCCAATTTTTCCGGCGTATATAGATTCAAGCGTCATCATCGGGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788709.1
MFQYAYSLSTRTGYRGYGAEQGSKDLREAIAETFYKDMGIQGAEVFVSDGAQCDISRLQMLFGSNMSIAVQDPIFPAYIDSSVIIGQTGDVEQGSRRQTSVSLFYIKN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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