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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001485`

染色体: Chr01 坐标: 28631904-28636743 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001485`
名称	SmilChr01G001485
描述	BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	28631904 - 28636743 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018455`
GeneID	`131018455`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018455`
原始查询	`SmilChr01G001485`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1-like
产物	BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1-like
Arabidopsis	`AT4G33430` (BAK1) BRI1-associated receptor kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829480] identity=81.2; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0174700` (BAK1) - identity=76.8; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018455

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057803158.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803158.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803158.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803158.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803158.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:28632217`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	176	A10,A11,A13,A14,A16,A18,A22,A24,A25,A3,A4,A7,A9,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B119,B12,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B21,B22,B23,B25,B26,B27,B29,B3,B32,B35,B36,B37,B4,B40,B41,B44,B45,B46,B47,B48,B50,B53,B54,B55,B56,B58,B59,B60,B61,B63,B64,B65,B67,B68,B69,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B8,B82,B84,B85,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B99,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C32,C35,C36,C37,C4,C41,C42,C43,C44,C46,C47,C48,C49,C50,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C74,C76,C78,C82,C83,C84,C85,C86,C9,D11,D2,D3,D6,D8,D9
`Chr1:28633235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:28633334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:28633473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B5,C75
`Chr1:28635488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B96,C25,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803158.1

617 aa

308

617

LRRNT_2

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF08263 LRRNT_2 30-69 aa PF00560 LRR_1 97-119 aa PF00560 LRR_1 121-143 aa PF00560 LRR_1 145-165 aa PF00560 LRR_1 170-186 aa PF00069 Pkinase 294-565 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 296-567 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803158.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	30	69	1.5e-10	41.8	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057803158.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	97	119	3.5e-14	50.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057803158.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	121	143	3.5e-14	50.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057803158.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	145	165	3.5e-14	50.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057803158.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	170	186	3.5e-14	50.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057803158.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	294	565	5.6e-44	151.2	Protein kinase domain
`XP_057803158.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	296	567	1.1e-44	153.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947175.1
GTCTTTTTGATGCTACGGTAAAAGGAAAATTACGTGAAAAAGTGACAAGGAACCAAACGTAATATACAGAGAGAGGGAGAGAGAAAGACAAGGTTTGACCATCAGCATCCCTTCTCTCTCTCTCCGCAACGACTTCCCACTCCTTTTTCCCATTCACGGACCGTTGATTTGAACAATCTACCCCCAAATTTCACTGCCAAAAAAAAATCAAAACGCACCTCACAATTTGAGCAAACAGTAGAAAAAAGAAAACAAGACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018455
ATGGATCGGTGGTCAATGGCCATGATCTTTCGGGCGGCTTATCTCTTCTTAATTCTGGTGTTTGCAAGATTTTCGCAGGTTTCTACAAACGTTGAAGGGGATGCGTTGAATGCACTGAAGATTAATCTGGCCGATCCTAACAATGTTCTTCAGAGTTGGGATCCGACCCTTGTCAATCCTTGTACATGGTTTCATGTCACATGCAATAGTGACAATTTTGTTACGCGTGTTGATCTCGGCAATGCAAATTTGTCGGGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803158.1
MDRWSMAMIFRAAYLFLILVFARFSQVSTNVEGDALNALKINLADPNNVLQSWDPTLVNPCTWFHVTCNSDNFVTRVDLGNANLSGQLVPQLGQLLSLQYLELYSNNISGRIPPELGNLTNLVSLDLYLNRLTGPIPDTLYKLQRLRFLRLNNNSLTGQIPNSLTTIDTLQVLDLSNNNLTGPIPTNGSFQLFTPISFQGNQLDPLPPPPPSVPPTTPSGSGVGNSATGAIAGGVAAAAAFLFAVPAIALAWYRRRKPQD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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