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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001499`

染色体: Chr01 坐标: 28848155-28850440 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001499`
名称	SmilChr01G001499
描述	putative clathrin assembly protein At1g03050
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	28848155 - 28850440 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018536`
GeneID	`131018536`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018536`
原始查询	`SmilChr01G001499`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative clathrin assembly protein At1g03050
产物	putative clathrin assembly protein At1g03050
Arabidopsis	`AT1G03050` (AT1G03050) ENTH/ANTH/VHS superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839416] identity=51.3; qcov=1.07; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0426100` - identity=45; qcov=1.06; evalue=3.7e-157; confidence=high
GO	GO:0000149 (SNARE binding); GO:0005545 (1-phosphatidylinositol binding); GO:0005546 (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding); GO:0005905 (clathrin-coated pit); GO:0006900 (vesicle budding from membrane); GO:0030136 (clathrin-coated vesicle); GO:0032050 (clathrin heavy chain binding); GO:0048268 (clathrin coat assembly); GO:0072583 (clathrin-dependent endocytosis)
KEGG	-
Pfam	PF01417 (ENTH); PF07651 (ANTH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018536

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057803237.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057803237.1`
3	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.40000	`XP_057803237.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803237.1`
5	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.20000	`XP_057803237.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:28848442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,D9
`Chr1:28848553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C64,C66
`Chr1:28848565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,B89,C28
`Chr1:28848575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr1:28848585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr1:28848693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:28848716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B122,B135
`Chr1:28848735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr1:28848739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,D9
`Chr1:28848743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B13
`Chr1:28848807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr1:28848848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803237.1

561 aa

280

561

ENTH

ANTH

PF01417 ENTH 31-151 aa PF07651 ANTH 32-308 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803237.1`	Pfam	`PF01417`	ENTH	Repeat	31	151	4.3e-06	27.5	ENTH domain
`XP_057803237.1`	Pfam	`PF07651`	ANTH	Repeat	32	308	5.6e-71	239.5	ANTH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947254.1
TCAAAGAGGAGATGAAGAAGATTGTGAGGAAGATAGAGAGAGACACAGAGAGAGAAGAAGAAACAAACAGGAGTTGTACCTGTTTTGATTCTTGAATCGAAAAAGGTAATTCTCTTCTCCTTTCTTCTTTCTCCGCCCCTCGTTCCACACAACATTGGATCCTCATTCTTGCATCCTGAACAAGTGAAAAAAAGTTGAAGAATCAATCAATCTCAGCAAATAAGAGTTCATCACCGTTGGATTGCGCATGGCCCCGAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018536
ATGGCCCCGAGCAAGATCAGACAAGTTATCGGAGCAGTGAAGGATCAAACCAGCATTGGCCTGGCCAAGGTCGCCGGTAGCAGCTCCCTCTCCGACCTCGAAGTTGCCATCGTCAAAGCCACCCGCCATGGCCAGAACCCACCCAACCAGTGCTATGTGGCCGAGATCCTCAGCCTTACGTGCTACTCGCACGCCATGGTCAACTCATGCATCGGCATCATTGCCAGGCGCCTCAACAGGACCAAGAACTGGGTGGTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803237.1
MAPSKIRQVIGAVKDQTSIGLAKVAGSSSLSDLEVAIVKATRHGQNPPNQCYVAEILSLTCYSHAMVNSCIGIIARRLNRTKNWVVALKALLLVQRLLSQGGSAFEQEIFFTTRRGTRFLNMCDFRDSSRKAWDYSAFVRTYALYLDELLEFRMQGHAERGRDYKVEEEEDAVVVRAPLVSEMENEAVFCRADHLMQLLERFLACRPTGGAKHNRIVVVALYPILKESFQIYHCITEILGTLIERFMQMDVPDMMQVHDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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