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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001530`

染色体: Chr01 坐标: 29290857-29292373 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001530`
名称	SmilChr01G001530
描述	protein ALP1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	29290857 - 29292373 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005864`
GeneID	`131005864`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005864`
原始查询	`SmilChr01G001530`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALP1-like
产物	protein ALP1-like
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=37.7; qcov=0.75; evalue=4.19e-60; confidence=medium
Rice	`Os08g0106900` - identity=45.7; qcov=0.669; evalue=5.69e-74; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005864

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788952.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057788952.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057788952.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788952.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788952.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:29290866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,A7,B107,B45,B80
`Chr1:29290900`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C83
`Chr1:29290900`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C83
`Chr1:29290904`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D9
`Chr1:29290904`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D9
`Chr1:29290933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr1:29290960`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr1:29290960`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr1:29290978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B28,C48,C67,C68
`Chr1:29290990`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B107,B37,B63
`Chr1:29290990`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B107,B37,B63
`Chr1:29291032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B44,C42,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788952.1

396 aa

198

396

DUF8040

Plant_tran

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

PF26138 DUF8040 1-70 aa PF04827 Plant_tran 93-264 aa PF01609 DDE_Tnp_1 96-259 aa PF13359 DDE_Tnp_4 102-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788952.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	1	70	1.1e-20	74.0	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057788952.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	93	264	6.9e-08	33.1	Plant transposon protein
`XP_057788952.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	96	259	2.5e-09	37.9	Transposase DDE domain
`XP_057788952.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	102	262	1.1e-28	100.6	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932969.1
ATGGATAGATACACGTTTAGAAGGCTAGTTAACATGCTTCAAACGATTGGACGGCTAAGAGCTACAAGAAACCTGACAGTTGATGAGCAAGTTGCTATTTTCTTATACATACTAGCTCATCATCAAAAGAACCGTACAATGAAAACTAATTTCTTGCGGTTAGGAGAAACAATTAGTAGATATTTCAATAAGGTATTGAGCTCAGTTCTTAGGCTTCAAGGTCATTTACTAAAAGTTCCTTCACCTGTAGCTGAGGATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005864
ATGGATAGATACACGTTTAGAAGGCTAGTTAACATGCTTCAAACGATTGGACGGCTAAGAGCTACAAGAAACCTGACAGTTGATGAGCAAGTTGCTATTTTCTTATACATACTAGCTCATCATCAAAAGAACCGTACAATGAAAACTAATTTCTTGCGGTTAGGAGAAACAATTAGTAGATATTTCAATAAGGTATTGAGCTCAGTTCTTAGGCTTCAAGGTCATTTACTAAAAGTTCCTTCACCTGTAGCTGAGGATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788952.1
MDRYTFRRLVNMLQTIGRLRATRNLTVDEQVAIFLYILAHHQKNRTMKTNFLRLGETISRYFNKVLSSVLRLQGHLLKVPSPVAEDSSDVKWKWFKNCIGTLDGTHIEVKVSEVDKPRYRNRKGHTSTNVLGVCSQDMQFIYVLAGWEGSAADGRVLRDALSRRNGLPIQDGYYYLVDAGYTNGKGFLAPFRGQRYHLSEWRTGRQPTTPEEYFNMKHSSARNVIERCFGMLKMRWDIIRNPNFYPIKQQDRIIMACCLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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