当前解析结果
SmilChr01G001568| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001568 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001568 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001568 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 29683500 - 29685237 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018911 |
|---|---|
| GeneID | 131018911 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018911 |
| 原始查询 | SmilChr01G001568 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os04g0590366- identity=28.9; qcov=0.764; evalue=2.4e-19; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018911 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803585.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803585.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803585.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803585.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057803585.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:29684053 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B44 |
Chr1:29684068 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C2 |
Chr1:29684069 |
CTG |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 22 | A19,A3,B122,B42,B51,B52,B54,B57,B77,B81,B88,B90,C17,C19,C20,C24,C44,C48,C52,C55,C58,C62 |
Chr1:29684071 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 24 | A1,B10,B105,B113,B117,B121,B129,B139,B14,B21,B25,B4,B41,B58,B74,B93,C18,C20,C27,C41,C66,C74,C9,D10 |
Chr1:29684072 |
C |
CTT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 19 | A19,A3,B122,B42,B51,B52,B54,B57,B77,B88,C17,C19,C20,C24,C44,C52,C55,C58,C62 |
Chr1:29684081 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr1:29684098 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B74 |
Chr1:29684099 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
Chr1:29684111 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C35,C56 |
Chr1:29684116 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B38,B80,C10,C16,C38 |
Chr1:29684125 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B40,C28 |
Chr1:29684128 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A11,B103,B12,B22,B66 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。