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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001570`

染色体: Chr01 坐标: 29715007-29716116 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001570`
名称	SmilChr01G001570
描述	probable beta-1,4-xylosyltransferase IRX10
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	29715007 - 29716116 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018926`
GeneID	`131018926`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018926`
原始查询	`SmilChr01G001570`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable beta-1,4-xylosyltransferase IRX10
产物	probable beta-1%2C4-xylosyltransferase IRX10
Arabidopsis	`AT1G27440` (GUT2) Exostosin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839635] identity=84.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0926700` (OsIRX10) - identity=84.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006486 (GO:0006486); GO:0009834 (plant-type secondary cell wall biogenesis); GO:0010417 (glucuronoxylan biosynthetic process); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03016 (Exostosin_GT47)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018926

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057803594.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057803594.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803594.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803594.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803594.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:29715090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:29715177`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D4
`Chr1:29715177`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D4
`Chr1:29715310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B4,C47,C68
`Chr1:29715359`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B65
`Chr1:29715359`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B65
`Chr1:29715424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:29715442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,C53,C78
`Chr1:29715541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B15,C16,C86
`Chr1:29715574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr1:29715606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr1:29715847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B30,B56,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803594.1

341 aa

170

341

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 2-268 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803594.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	2	268	2.8e-65	221.3	Exostosin GT47 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947611.1
CGGTGTCTCACACACATGTTCGCCGCTGAGATATTCATGCACCGTTTCCTCCTAAGCAGCCTTGTCCGAACCACCAACCCCGACCAAGCTGATTGGTTCTACACCCCCGTCTACCAAACCTGTGACCTCGCCCCCAACGGCTTGCCCATGACCATAAAGTCGCCCAGAATGATGCGCAGCGCCATCCACTTCATCTCCACCACTTGGCCTTACTGGAATCGAACCCAAGGCGCCGACCACTTCTTCCTCGTGCCCCATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018926
ATGTTCGCCGCTGAGATATTCATGCACCGTTTCCTCCTAAGCAGCCTTGTCCGAACCACCAACCCCGACCAAGCTGATTGGTTCTACACCCCCGTCTACCAAACCTGTGACCTCGCCCCCAACGGCTTGCCCATGACCATAAAGTCGCCCAGAATGATGCGCAGCGCCATCCACTTCATCTCCACCACTTGGCCTTACTGGAATCGAACCCAAGGCGCCGACCACTTCTTCCTCGTGCCCCATGATTTTGGAGCCTGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803594.1
MFAAEIFMHRFLLSSLVRTTNPDQADWFYTPVYQTCDLAPNGLPMTIKSPRMMRSAIHFISTTWPYWNRTQGADHFFLVPHDFGACFHYQEERAIERGILPLLQRSTLVQTFGQRYHVCLNEGSITIPPYAPPERIMSQLIPPHTPRSIFVYFRGLFYDTDNDPEGGYYARGARASIWENFKNNPLFDISTEHPTTYYQDMQRAVFCLCPLGWAPWSPRLVEAVVFGCIPVIIADDIVLPFADAIPWEEIGVFVAEKDVP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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