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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001584`

染色体: Chr01 坐标: 29864531-29866855 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001584`
名称	SmilChr01G001584
描述	F-box protein At1g10780
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	29864531 - 29866855 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019160`
GeneID	`131019160`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019160`
原始查询	`SmilChr01G001584`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At1g10780
产物	F-box protein At1g10780
Arabidopsis	`AT1G10780` (AT1G10780) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837621] identity=62.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0454300` (OsFbox491) - identity=54.8; qcov=1; evalue=1.05e-160; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF12937 (F-box-like); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019160

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803832.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803832.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803832.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803832.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803832.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:29865338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr1:29865370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:29865418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr1:29865568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B105,B130
`Chr1:29865574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,D9
`Chr1:29865831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr1:29865937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B1,C87
`Chr1:29865970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,C16,C86
`Chr1:29866172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,D9
`Chr1:29866262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C48
`Chr1:29866391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B105,B130
`Chr1:29866565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,C16,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803832.1

419 aa

210

419

F-box-like

LRR_At5g56370

PF12937 F-box-like 2-36 aa PF24758 LRR_At5g56370 88-295 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803832.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	2	36	1.4e-06	28.7	F-box-like
`XP_057803832.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	88	295	9.8e-08	32.6	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947849.1
GCTTCGTGATTCACTGACACCCAATATTTTAAAATATGAAAAACTAAAATAAAGAAAAAATAAAAGTCTCTTCTCCCCCCTTGTTTCAAAATTTGAAAAATCCCCCCTTCGGCATCTGCTTCCATATACCCGCGCCTTGCAATTCTTTTTCACGCATGTTTATATAGAGATGTATGTACACATACACACACACAAGTGTGTGTATTTTCTCAAGGAAATATACTAACAGACTGCGCGATAGGTTTCTAAAATTGAAGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019160
ATGGAGTCACTCCCTGATGCCATAGTCCAGTCAATTTTGTCCCTAATGAGTAATCCCAAGGATGTGGCGTCGTGCAATTGCGTTTCCAAGAGATGGAAAGATTCGACGCCATATCTGAGGAGCCTATTCTTTTCTCGAAATCTTTTTGACAACCTAACCAATGGAGATACTCCTGATGATGTTATCTTGCGGCTGGTGTCTTCAGTTATTAAACTTGAGGAGCTTGTGGTTTACTGCCCATTTTCAGGCTCCGGCCTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803832.1
MESLPDAIVQSILSLMSNPKDVASCNCVSKRWKDSTPYLRSLFFSRNLFDNLTNGDTPDDVILRLVSSVIKLEELVVYCPFSGSGLASWLSMAGSSLRNLELRLDNITEYDTYTEIPSKLDCIRAAWNVESLKLWGVLMVYSPKWDVFHRLKNLEIVGARLEEDALYYALRACPNLTHLLLLGCEGLRSISIQNPYLEQCKLDFFGVGNCSLTVNSSKLESLEVQGCSLIRVCETQCLRNLSISNNAGRVYMVDFGKLVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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