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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001600`

染色体: Chr01 坐标: 30158031-30161445 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001600`
名称	SmilChr01G001600
描述	cytochrome c oxidase assembly protein COX15
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30158031 - 30161445 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019055`
GeneID	`131019055`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019055`
原始查询	`SmilChr01G001600`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome c oxidase assembly protein COX15
产物	cytochrome c oxidase assembly protein COX15
Arabidopsis	`AT5G56090` (COX15) cytochrome c oxidase 15 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835708] identity=79.3; qcov=0.86; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0496000` - identity=77.4; qcov=0.79; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0006784 (heme A biosynthetic process); GO:0016653 (oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H, heme protein as acceptor)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00860 (Porphyrin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02628 (COX15-CtaA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019055

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057803722.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057803722.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057803722.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803722.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803722.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30158678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:30158712`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B37
`Chr1:30158712`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B37
`Chr1:30159652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr1:30159666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B103,B106,B49,C44
`Chr1:30160485`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B108
`Chr1:30160485`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B108
`Chr1:30161239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803722.1

471 aa

236

471

COX15-CtaA

PF02628 COX15-CtaA 116-447 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803722.1`	Pfam	`PF02628`	COX15-CtaA	Family	116	447	2.8e-113	378.9	Cytochrome oxidase assembly protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947739.1
GTGTAAAGTACATGCTACATGTAGATTTATCTGGTTAAGATTTAAGAAGTCACAAAATTAGATCGGTTTCGGGTCACGGATTCGAATAAACCGGTTCGTCACCATCTTCTTCAAAAACCCCCCTAAACCCCATTGCTTGTGACTGAAGCCACTGTAAAGGAAGGGAGAAGAAAGACGGCAAGATTTTGCCCATCTATACAATGATCGAAAGTCGGTTGCTTCTTCTGCTACGGAAATCCAAATCCGTAGCCTTAAAATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019055
ATGATCGAAAGTCGGTTGCTTCTTCTGCTACGGAAATCCAAATCCGTAGCCTTAAAATTTTCCTCATCGAATTCCACAAGATGTAATGCATTTTCCCCACATTTTGGACTCTCAGTTGAGCCACAATCCAGATCTTATTCGTTGTTTCCAAGAATTATCCCTGGAGCCCCGGTCACACGAAGCTTAGTCAGCCGCGGTTTAAGATCGTTGCTTCAAAATGATATGAAGAACTTCTGTAAACCCTCGTTCAGAAATTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803722.1
MIESRLLLLLRKSKSVALKFSSSNSTRCNAFSPHFGLSVEPQSRSYSLFPRIIPGAPVTRSLVSRGLRSLLQNDMKNFCKPSFRNFSTSASISSKNTGGVKLLVNAGPKAQKAVGIWLFVSAAWVFSMVVLGGVTRLTRSGLSMTDWKFSGGLPPLSDEEWLVEFEKYKQSPEYKRINKGMSLDDFKFIYWMEYAHRMWGRALGIMFALPFSYFLRKGYITVQLGLRLSGLFALGAGQGLIGWWMVKSGLEEPASEYTEP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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