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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001610`

染色体: Chr01 坐标: 30253503-30255496 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001610`
名称	SmilChr01G001610
描述	uncharacterized SmilChr01G001610
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30253503 - 30255496 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019397`
GeneID	`131019397`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019397`
原始查询	`SmilChr01G001610`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsPP16; symbol=OsPP16; hit=Os01g0859400; species=rice; confidence=high
产物	OsPP16; symbol=OsPP16; hit=Os01g0859400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0859400` (OsPP16) - identity=63.1; qcov=1; evalue=2.85e-117; confidence=high
GO	GO:0006470 (protein dephosphorylation); GO:0008138 (protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00782 (DSPc); PF22785 (Tc-R-P)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019397

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057803926.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057803926.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057803926.1`
4	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057803926.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803926.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30253904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:30253937`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B1
`Chr1:30253937`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B1
`Chr1:30253983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,C15,D9
`Chr1:30254051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B62,B66,C26,C35,C45
`Chr1:30254136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr1:30254171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B3,B86,C15,C80
`Chr1:30254327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C11,C69
`Chr1:30254351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C43
`Chr1:30254365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803926.1

244 aa

122

244

DSPc

Tc-R-P

PF00782 DSPc 124-232 aa PF22785 Tc-R-P 138-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803926.1`	Pfam	`PF00782`	DSPc	Domain	124	232	9e-11	42.4	Dual specificity phosphatase, catalytic domain
`XP_057803926.1`	Pfam	`PF22785`	Tc-R-P	Domain	138	198	3.4e-06	28.3	Polymorphic toxin system, DSP-PTPase phosphatase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947943.1
AATTTTTTTTTATTGAATTTCATTATCATCTATATTTGACTACTTTTAATTCAAAATCTTTAATATTGTATAAAAATTTCCATAAATTTATTAATATATAGTATTAAACAACAACAACAATAATAATTACATTATTTAGAAGGGAAAGTACGTTTATTTTTCACGCCACAACCAAAACCTATGAAAACCCCAATTCCCCAATTCTCACGCCACAACCAAAACCTATGAAAACCCCATTGTTTTCCTACTCGGATTGATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019397
ATGGGTGTGGGTTTATCCGTCCTCATAGGCTTAAAGTGTGCAACTTTATTCATCTTCTTTCTCTCTCTTCGGATGTTTCAATTCACTTTGCTATCAGTCCCATTCTTGTATGCATCTCTGGTGTCATTCCTGGTTTCCATTGCTTCCCATCCATCAATCAATCTGCCGATTCTTTTGGGGAAAGGATCAGATGGGAATTTCCCAATCTGGTCATTGATCATGTTCAGCCCTTACTTGTATTTTGTGAGGGCTTTTTCATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803926.1
MGVGLSVLIGLKCATLFIFFLSLRMFQFTLLSVPFLYASLVSFLVSIASHPSINLPILLGKGSDGNFPIWSLIMFSPYLYFVRAFSFIRRFTSGEPPYTKISEGLYVGGWPYAPEKLPPGNPAIVDCTCELPRKKELTGSAYLCVPTWDTRSPEPGEIESAVNWASRKRAQGVPVFVHCAYGHGRSVAVMCALLVALGLAEDWKTAERMIKEKRPYIRMNALHRKALEEWSKDRLSTPKRRGQS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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