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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001613`

染色体: Chr01 坐标: 30259574-30263694 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001613`
名称	SmilChr01G001613
描述	uncharacterized SmilChr01G001613
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30259574 - 30263694 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006061`
GeneID	`131006061`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006061`
原始查询	`SmilChr01G001613`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0499600; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os09g0499600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G17450` (AT3G17450) hAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821009] identity=31.1; qcov=0.799; evalue=2.53e-84; confidence=low
Rice	`Os09g0499600` - identity=35; qcov=0.786; evalue=4.1e-97; confidence=medium
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF04937 (DUF659); PF05699 (Dimer_Tnp_hAT); PF26664 (zf-BED_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006061

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789187.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789187.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789187.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789187.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789187.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30259605`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D9
`Chr1:30259605`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D9
`Chr1:30259609`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D9
`Chr1:30259609`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D9
`Chr1:30259621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B111,B51,C74
`Chr1:30259639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B108,B58,B67,C82
`Chr1:30259642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr1:30259939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B3,B86,C15,C80
`Chr1:30259952`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	66	A11,A13,A2,A25,A3,A5,B10,B101,B104,B105,B11,B112,B113,B117,B121,B13,B140,B16,B20,B21,B27,B28,B3,B30,B35,B4,B44,B45,B47,B48,B55,B58,B6,B64,B67,B69,B73,B85,B89,B93,C10,C2,C27,C28,C34,C42,C46,C48,C51,C53,C56,C58,C60,C61,C62,C63,C65,C67,C74,C76,C8,C81,C82,D1,D4,D5
`Chr1:30260024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B29,B35,C48
`Chr1:30260026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	55	A14,A20,B10,B105,B109,B12,B122,B123,B124,B135,B15,B16,B17,B18,B3,B30,B32,B37,B48,B50,B57,B59,B6,B60,B63,B65,B69,B71,B75,B78,B8,B80,B88,B89,B90,B92,C11,C16,C24,C3,C30,C31,C38,C4,C40,C47,C53,C56,C69,C78,C87,D2,D5,D6,D8
`Chr1:30260032`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	137	A10,A13,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A22,A23,A6,B10,B101,B103,B105,B107,B108,B109,B11,B111,B118,B12,B122,B123,B124,B125,B128,B129,B132,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B140,B15,B16,B17,B18,B22,B23,B24,B26,B27,B29,B3,B30,B32,B35,B36,B37,B4,B42,B43,B48,B5,B50,B51,B52,B54,B56,B57,B59,B6,B60,B63,B65,B69,B71,B73,B74,B75,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B84,B88,B89,B90,B92,B93,B96,B98,B99,C11,C16,C17,C24,C25,C27,C3,C30,C31,C32,C33,C36,C38,C4,C40,C43,C46,C47,C48,C49,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C67,C68,C69,C71,C74,C78,C81,C82,C84,C86,C87,D1,D10,D11,D2,D4,D5,D6,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789187.1

687 aa

344

687

zf-BED_2

DUF659

Dimer_Tnp_hAT

PF26664 zf-BED_2 38-69 aa PF04937 DUF659 173-260 aa PF04937 DUF659 272-340 aa PF05699 Dimer_Tnp_hAT 529-591 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789187.1`	Pfam	`PF26664`	zf-BED_2	Domain	38	69	8e-08	32.6	BED-like zinc finger
`XP_057789187.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	173	260	2.5e-49	167.5	Domain of unknown function (DUF659)
`XP_057789187.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	272	340	2.5e-49	167.5	Domain of unknown function (DUF659)
`XP_057789187.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	529	591	8.6e-09	35.8	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933204.1
ATGAGGATGGTGAGGGAAGAGCAGGAGGCGATGTCGGTGGCGGAGAGAAGGGAGTCGAAGGTGGAGAAGGAGGGGCAGGAAGAGAGGAGGAGGGTGATCAAGAACATTTCTGGAGGTGTAAAAAGAGTGAAGGATCACCTTGCATGCAATCATAAAGAAGTGGCGATATGTCGGAAGGTACCTGATGATGTGAAGAACGAGATACAGGTGTACTTGAGTGCCTTCACCGACAACAAGCACAAAAAGCAAAGAAATTATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006061
ATGAGGATGGTGAGGGAAGAGCAGGAGGCGATGTCGGTGGCGGAGAGAAGGGAGTCGAAGGTGGAGAAGGAGGGGCAGGAAGAGAGGAGGAGGGTGATCAAGAACATTTCTGGAGGTGTAAAAAGAGTGAAGGATCACCTTGCATGCAATCATAAAGAAGTGGCGATATGTCGGAAGGTACCTGATGATGTGAAGAACGAGATACAGGTGTACTTGAGTGCCTTCACCGACAACAAGCACAAAAAGCAAAGAAATTATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789187.1
MRMVREEQEAMSVAERRESKVEKEGQEERRRVIKNISGGVKRVKDHLACNHKEVAICRKVPDDVKNEIQVYLSAFTDNKHKKQRNYKEMVDSGSYSKVAMLLLGVRGPMDRYMVSDKDGQIPPPKPKKHRNQVCLDIGRFFYENAIPFHAATSASFVSMVQSIGNYGRGLKPPSMHELRNWKLDEEKKTTEKIVDEIKETWKKTGVSILSDGWSDMRNRSLINFLVNNQYGTIFLRTVDASDCVKDAQKLFELLDDVVRD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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