当前解析结果
SmilChr01G001614| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001614 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001614 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001614 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 30274491 - 30275147 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006070 |
|---|---|
| GeneID | 131006070 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006070 |
| 原始查询 | SmilChr01G001614 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os11g0303800; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os11g0303800; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT5G41220 (GSTT3)glutathione S-transferase THETA 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834124] identity=25.3; qcov=0.706; evalue=1.83e-10; confidence=low |
| Rice | Os11g0303800- identity=26.2; qcov=0.771; evalue=4.93e-13; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006070 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057789198.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789198.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057789198.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057789198.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057789198.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:30274521 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | A13,B109,B138,C24,C59,C6,C67,D4 |
Chr1:30274602 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B124,B131,C24 |
Chr1:30274606 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A15,B89 |
Chr1:30274607 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B68 |
Chr1:30274607 |
CA |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B68 |
Chr1:30274611 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C33 |
Chr1:30274612 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,C24 |
Chr1:30274618 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,C22,C47,D3 |
Chr1:30274619 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C26,C45 |
Chr1:30274622 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B120,B92 |
Chr1:30274624 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C69 |
Chr1:30274629 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B54,C50,C51,D5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。