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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001618`

染色体: Chr01 坐标: 30286971-30294955 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001618`
名称	SmilChr01G001618
描述	uncharacterized SmilChr01G001618
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30286971 - 30294955 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018988`
GeneID	`131018988`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018988`
原始查询	`SmilChr01G001618`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proline-, glutamic acid/leucine-rich protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839904]; symbol=AT1G30240; hit=AT1G30240; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	proline-, glutamic acid/leucine-rich protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839904]; symbol=AT1G30240; hit=AT1G30240; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G30240` (AT1G30240) proline-, glutamic acid/leucine-rich protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839904] identity=42.5; qcov=0.825; evalue=5.12e-140; confidence=medium
Rice	`Os05g0295900` - identity=35.3; qcov=1.09; evalue=9.7e-120; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006364 (rRNA processing)
KEGG	-
Pfam	PF08167 (RIX1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018988

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803658.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803658.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803658.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803658.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803658.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30288133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:30288178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C36
`Chr1:30288304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:30289900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B139
`Chr1:30290638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:30290953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B112,B126,C22,C6
`Chr1:30290954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B139
`Chr1:30290977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B24,C85
`Chr1:30291185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr1:30291260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B139
`Chr1:30291463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B139
`Chr1:30291585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A2,B103,B17,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803658.1

841 aa

420

841

RIX1

PF08167 RIX1 19-221 aa

XP_057803662.1

698 aa

349

698

RIX1

PF08167 RIX1 1-78 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803658.1`	Pfam	`PF08167`	RIX1	Repeat	19	221	4.3e-37	128.4	rRNA processing/ribosome biogenesis
`XP_057803662.1`	Pfam	`PF08167`	RIX1	Repeat	1	78	2.4e-09	37.9	rRNA processing/ribosome biogenesis

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947675.1
TTCTCACATCTGCCGCGCGCGCTCTCTTCGATTTCTGCCGCTCTCTCTGCCGTCCGCCGCCACCCCCACCTCCTCCGGTCCGTCCAAGCGCCAAGCAGGCAGCACAGAAGCAGTCCGCCGCCCAACCCTCGCCGGCTCGCCCCGCTCCGTCTCCTTCGATTGACAGCAACAGTGCGCGACTGCGACGTGCCTCCACCCTCACCTAGGCTTCACCGTCGCTCCGCCACGCCTCCTTCGGCCTCGGTACCTCCGTCCGCGAC...

XM_057947679.1
CACCGTCAAAACGCATAAATTGCTATCAGAACGGACACCGCCGGAGGCCCAACAGGATTTGGTGGATGCTTGGAAATCGGCCGTTGATTCTTGGGTCAATCGATTGCTCGTGTTGGCGTCTAGCAATTTGATAAGTGTTGGGCTGGGATATGTTTGCTTGGATTGACCTGTCAAGAATGCAGTTCAGAGCGCTTTTCAACTTCATATGATGTTTGGTTGAACAAGCTTCTCGTTCATGTGCAGCCTTCAGAATTTTCTCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131018988
ATGTCGGCGCCGGAGGTCATGTATGATGTCGTAATGAAGCCGAAGTTGCTCCGATCGCTGCTGAGGGAGTACGTTCCCGATGAGAAACACCCCTTCACTAACCCTTCGGAGCTGTCGTACGTTGTCTCCACCGTCAAAACGCATAAATTGCTATCAGAACGGACACCGCCGGAGGCCCAACAGGATTTGGTGGATGCTTGGAAATCGGCCGTTGATTCTTGGGTCAATCGATTGCTCGTGTTGGCGTCTAGCAATTTGCC...

LOC131018988
ATGTTTACAAGGCTGGATGAATTTTCAAATGTGAAAAAGGATGCAACTTCACAGGCAACAAAAGTTGTTCAGCTGTCACTGAAGCTGTTAAATGAGGAGAGCTCCTCTGTTGTATTGGAAGAAGCTATGTGTCTCATTCGTACCTTGATTTATCACTTTCCTTCGTCAGTCCACCGACATTATGAATCTGTTGAAGCTGCCATTGTTTCAAAGCTCATATCTGGAAAATGCTCTCCCAGTGTTTTGAAGAACCTGGGTTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057803658.1
MSAPEVMYDVVMKPKLLRSLLREYVPDEKHPFTNPSELSYVVSTVKTHKLLSERTPPEAQQDLVDAWKSAVDSWVNRLLVLASSNLPDKCWAGICLLGLTCQECSSERFSTSYDVWLNKLLVHVQPSEFSHFVKAASCASLSDMFTRLDEFSNVKKDATSQATKVVQLSLKLLNEESSSVVLEEAMCLIRTLIYHFPSSVHRHYESVEAAIVSKLISGKCSPSVLKNLGCGLSLLPKSRGDEDSWCVMMNKILLYVNSQL...

XP_057803662.1
MFTRLDEFSNVKKDATSQATKVVQLSLKLLNEESSSVVLEEAMCLIRTLIYHFPSSVHRHYESVEAAIVSKLISGKCSPSVLKNLGCGLSLLPKSRGDEDSWCVMMNKILLYVNSQLNDAFQGLEEETRSAKAMRALLPAGKTPPPPLGGSATSEQNSDISTRSPERLLASRISSLLQCCSDMLTTSYPVMVQVPICGLISLSGRVLLVDGSLPLSSYSFMTTLKQEFICSEIPNLQFQSLEILTAIVKGLGSQVLPYVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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