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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001619`

染色体: Chr01 坐标: 30296305-30300618 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001619`
名称	SmilChr01G001619
描述	diphosphomevalonate decarboxylase 2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30296305 - 30300618 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019149`
GeneID	`131019149`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019149`
原始查询	`SmilChr01G001619`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	diphosphomevalonate decarboxylase 2
产物	diphosphomevalonate decarboxylase 2
Arabidopsis	`AT3G54250` (AT3G54250) GHMP kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824592] identity=76.7; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0109100` - identity=73.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004163 (diphosphomevalonate decarboxylase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0008299 (isoprenoid biosynthetic process); GO:0019287 (isopentenyl diphosphate biosynthetic process, mevalonate pathway)
KEGG	smil00900 (Terpenoid backbone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00288 (GHMP_kinases_N); PF18376 (MDD_C); PF22700 (MVD-like_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019149

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057803821.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803821.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057803821.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803821.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803821.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30297649`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr1:30297649`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr1:30297657`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr1:30297657`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803821.1

422 aa

211

422

MVD-like_N

GHMP_kinases_N

MDD_C

PF22700 MVD-like_N 18-191 aa PF00288 GHMP_kinases_N 111-166 aa PF18376 MDD_C 205-405 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803821.1`	Pfam	`PF22700`	MVD-like_N	Domain	18	191	2.6e-64	216.4	Diphosphomevalonate decarboxylase-like N-terminal domain
`XP_057803821.1`	Pfam	`PF00288`	GHMP_kinases_N	Domain	111	166	1e-05	26.4	GHMP kinases N terminal domain
`XP_057803821.1`	Pfam	`PF18376`	MDD_C	Domain	205	405	2.4e-66	223.8	Mevalonate 5-diphosphate decarboxylase C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947838.1
GAAGCTTATGACTTCAAATTTGACTAATTCTTTTAAGAAAAAATTAAACCTTAAACCCTAATAAAACGTAATCAAGTTTGAAGTAAAACATGAATGAGAAAGCGGCCCCACAGCGGCTGCCTAGTTTGTAACGAAGCCTAACTGTTTTTTAAGTTCATTCAACAATGGCGTTCCTCTGTTCTGACCAATCTACCCCTTCACACACACACTGCGCATGAACATATACGTGCAACCAACTGAATCTACACACTCACACCGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019149
ATGGCGGCGGAGCGCGGCGAGAAATGGGTTCTGAGTGTGACGGCGCAGACGCCGACGAACATAGCGGTGATTAAGTACTGGGGGAAGAGGGACGAGGAGCTGATTCTTCCGATCAACGACAGCATCAGCGTCACGCTCGACCCTGGCCACCTCTGCACCACCACCTCCGTCGCTGTCAGCCCCGCCTTCACCCATGATCGTATCTGGCTCAACGGAAAGGAGGTATCTCTTTCTGGAGGCAGATTCCAAAATTGCTTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803821.1
MAAERGEKWVLSVTAQTPTNIAVIKYWGKRDEELILPINDSISVTLDPGHLCTTTSVAVSPAFTHDRIWLNGKEVSLSGGRFQNCLRELRSRATDFEDEKKGIKINKKDWEKLRVHIVSYNNFPTAAGLASSAAGLACLVFSLAKLMNVKEDHSKLSAIARQGSGSACRSLYGGFVKWIMGKEDNGSDSIAVQLADEKHWDDLVIIIAVVSSKQKETSSTSGMRDTVETSALIKHRAKEVVPKRIKEMEEAIAKRDFPSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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