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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001629`

染色体: Chr01 坐标: 30359623-30362373 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001629`
名称	SmilChr01G001629
描述	nifU-like protein 4, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30359623 - 30362373 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019380`
GeneID	`131019380`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019380`
原始查询	`SmilChr01G001629`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nifU-like protein 4, mitochondrial
产物	nifU-like protein 4%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G20970` (NFU4) NFU domain protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821647] identity=80.5; qcov=0.789; evalue=2.21e-132; confidence=high
Rice	`Os05g0155300` (OsISC15) - identity=83; qcov=0.757; evalue=9.94e-129; confidence=high
GO	GO:0005506 (iron ion binding); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0016226 (iron-sulfur cluster assembly); GO:0051536 (iron-sulfur cluster binding)
KEGG	-
Pfam	PF01106 (NifU); PF08712 (Nfu_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019380

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057803908.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057803908.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803908.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803908.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803908.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30359989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:30360035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr1:30360561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr1:30360583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B76,C21,C5,C73,C81
`Chr1:30361764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr1:30361810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr1:30362000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:30362084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B76,C21,C5,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803908.1

280 aa

140

280

Nfu_N

NifU

PF08712 Nfu_N 80-166 aa PF01106 NifU 194-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803908.1`	Pfam	`PF08712`	Nfu_N	Domain	80	166	1.4e-31	109.0	Scaffold protein Nfu/NifU N terminal
`XP_057803908.1`	Pfam	`PF01106`	NifU	Family	194	262	1.6e-29	102.6	NifU-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947925.1
TAATGCCTGCATAAAAAGAAAAAACAGAAACATAAGTATTAATTTCCTCATTGTCTCAAAAAAAAAGTATTAATTTCCTCTCACCACCATTGCCCTACCCTACCGCTACGCCTAAATCTCTCGAATTCCAGCAACCGGAAATCACCTCGGCCCCAATCCCTACACCACCAGTCCGCTGCCCCGCCGCTCGTCTCTCACTCCCTTCCAGTATTAGGCTGTTGCGGTGCTTTCGGCCACCGAAGTCCGGTAAGAGATAACTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019380
ATGAGAAATTGGGGAAGACTGGTAAATCGAGCTATTCTTCTGAGCAGTAGCAATGGCGGATTGCTATCGAAACCCTTAAATCCTCAAAATGGGGCTAGTGGGGCAGCCGCATCCCGCCGATGCATTTTCTCTTCTGCTTCGTCTTCTTCGAGTTATTTGTTGGATTTGAACGTGCTGAGGTCTTCATTACACTTCTCCCAGTGGAATCATTTTCAAGGGCAGAGGAGGAGCATGTTTATCCAAACACAGTCGACTCCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803908.1
MRNWGRLVNRAILLSSSNGGLLSKPLNPQNGASGAAASRRCIFSSASSSSSYLLDLNVLRSSLHFSQWNHFQGQRRSMFIQTQSTPNPASLMFHPGKQVMETGSADFPNARSAMSSPLAKSLFGIDGVTRVFFGSDFVTVTKSDEISWDLLKPQVFAAVMDFYSSGQPLILDSAAAASMDTAIQEDDSETVAMIKELLETRIRPAVQDDGGDIEYVGFDLDTGIVKLRMQGACSGCPSSSVTLKSGIENMLMHYVPEVKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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