当前解析结果
SmilChr01G001631| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001631 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001631 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001631 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 30369106 - 30370552 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131019459 |
|---|---|
| GeneID | 131019459 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131019459 |
| 原始查询 | SmilChr01G001631 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131019459 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803997.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.80000 | XP_057803997.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057803997.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803997.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803997.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:30369185 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B33,B8,B96,D8 |
Chr1:30369216 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B8,B96 |
Chr1:30369218 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A20,B5,C18,C59 |
Chr1:30369252 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,B76,C73,C81 |
Chr1:30369253 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B136,C11,C69 |
Chr1:30369263 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B104 |
Chr1:30369263 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr1:30369273 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,B126 |
Chr1:30369290 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B33,B8,B96 |
Chr1:30369319 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B131,B98,C48,C64 |
Chr1:30369376 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B20,B50,C82 |
Chr1:30369411 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B17,B25,C28 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。