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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001636`

染色体: Chr01 坐标: 30406005-30409798 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001636`
名称	SmilChr01G001636
描述	organelle RRM domain-containing protein 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30406005 - 30409798 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019504`
GeneID	`131019504`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019504`
原始查询	`SmilChr01G001636`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	organelle RRM domain-containing protein 1, chloroplastic
产物	organelle RRM domain-containing protein 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G20930` (AT3G20930) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821642] identity=58.4; qcov=0.774; evalue=1.33e-132; confidence=high
Rice	`Os02g0730800` (ORRM1) - identity=54; qcov=0.801; evalue=2.84e-117; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0016554 (cytidine to uridine editing); GO:0080156 (mitochondrial mRNA modification)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF21864 (MORF_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019504

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804038.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057804038.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804038.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804038.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804038.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30406083`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D5
`Chr1:30406083`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D5
`Chr1:30406202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr1:30406205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B13
`Chr1:30406862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr1:30407119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B64,C31
`Chr1:30407167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:30407174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:30407247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr1:30407250`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B110,B122
`Chr1:30407250`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B110,B122
`Chr1:30407605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,B96,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804038.1

407 aa

204

407

MORF_dom

RRM_1

PF21864 MORF_dom 90-181 aa PF21864 MORF_dom 204-294 aa PF00076 RRM_1 315-381 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804038.1`	Pfam	`PF21864`	MORF_dom	Domain	90	181	1.2e-72	240.5	Multiple organellar RNA editing factor 1, MORF domain
`XP_057804038.1`	Pfam	`PF21864`	MORF_dom	Domain	204	294	1.2e-72	240.5	Multiple organellar RNA editing factor 1, MORF domain
`XP_057804038.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	315	381	4.5e-20	72.0	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948055.1
AATTAAATTACGTATAATTTTCCCAAATTTATTTTGGCAGTCTATCCATAAACTTTCATGGTGCTGCACCTGCACGTAAACATGGAAGCGCTTCTCTCTTCTTCGACAGCCGCCGCCGTAGCGGCGTTTCCACCAATCTTAGCCAAACCTCTCACAAGCTCACATTGCAAAGTTCCCTTTCTCTCCCTCTCCTTCCCCGCCCGAGACCTCAGCTCTCCCAGTTCTACTCTTTCATCTTCTATTTCGACAACTGTCAGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019504
ATGGTGCTGCACCTGCACGTAAACATGGAAGCGCTTCTCTCTTCTTCGACAGCCGCCGCCGTAGCGGCGTTTCCACCAATCTTAGCCAAACCTCTCACAAGCTCACATTGCAAAGTTCCCTTTCTCTCCCTCTCCTTCCCCGCCCGAGACCTCAGCTCTCCCAGTTCTACTCTTTCATCTTCTATTTCGACAACTGTCAGAGCACAAATTGCTTCAGCTACCACTTCTTCGACGGCCCAGTCTGGAAAATTCAGTTCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804038.1
MVLHLHVNMEALLSSSTAAAVAAFPPILAKPLTSSHCKVPFLSLSFPARDLSSPSSTLSSSISTTVRAQIASATTSSTAQSGKFSSGSHNRHWMVVVEAPPRELTARSRIIDYYVSKVKSVLDSEKDAQRCIYDASCDTHFGFCCDIDEERANELASVPGVLSVKPDPDVDSTHKDYSSSSVELHTGSRPLCGSTLLFPAGTTKQWLVRMERPAIGAIRKAQVVDYYVQVLVRVLRNENDAQMCMYDISWQSNYGFCCEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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