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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001643`

染色体: Chr01 坐标: 30465156-30467833 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001643`
名称	SmilChr01G001643
描述	histidine-containing phosphotransfer protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30465156 - 30467833 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019584`
GeneID	`131019584`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019584`
原始查询	`SmilChr01G001643`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histidine-containing phosphotransfer protein 2-like
产物	histidine-containing phosphotransfer protein 2-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os09g0567400` (AHP2) - identity=38.2; qcov=0.557; evalue=1.52e-10; confidence=low
GO	GO:0000160 (phosphorelay signal transduction system); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009736 (cytokinin-activated signaling pathway); GO:0009927 (histidine phosphotransfer kinase activity); GO:0016310 (phosphorylation); GO:0043424 (protein histidine kinase binding)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01627 (Hpt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019584

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804142.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804142.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057804142.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804142.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804142.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30465600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,C71,D11
`Chr1:30465604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr1:30465621`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A19,A21,B108,B132,B136,B42,B43
`Chr1:30465634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B13,B53
`Chr1:30466193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B47,D7
`Chr1:30466411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A11,B76,C21,C5,C73,C81
`Chr1:30466681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,D11
`Chr1:30467493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B99
`Chr1:30467495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:30467504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804142.1

151 aa

151

Hpt

PF01627 Hpt 50-132 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804142.1`	Pfam	`PF01627`	Hpt	Domain	50	132	6.2e-08	33.5	Hpt domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948159.1
AAAACTTTGACGAACTCCAAACTATCAAACAAATAAAAAAGCAAAAGGTTGTGCCGCAAAATCTAAAAAAAATTCATCAGAATTTGGCGCTGCTGAAAACAGCATGGATTACAGGAGCATGGATACAGAAGCACTTGACCGAATGCTGCTTGATAGCATTCATGAACTCGAACAACAAAAATTGGTGGATCACCATTTCCGACAATGCCATTCATTGAAAGAGGACAATGGTTTGTCATTTTTCTTGGACCTCATTCTCA...

XM_057948167.1
AAAACTTTGACGAACTCCAAACTATCAAACAAATAAAAAAGCAAAAGGTTGTGCCGCAAAATCTAAAAAAAATTCATCAGAATTTGGCGCTGCTGAAAACAGCATGGATTACAGGAGCATGGATACAGAAGCACTTGACCGAATGCTGCTTGATAGCATTCATGAACTCGAACAACAAAAATTGGTGGATCACCATTTCCGACAATGCCATTCATTGAAAGAGGACAATGGTTTGTCATTTTTCTTGGACCTCATTCTCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019584
ATGGATTACAGGAGCATGGATACAGAAGCACTTGACCGAATGCTGCTTGATAGCATTCATGAACTCGAACAACAAAAATTGGTGGATCACCATTTCCGACAATGCCATTCATTGAAAGAGGACAATGGTTTGTCATTTTTCTTGGACCTCATTCTCATTTTTCTCAATGATGCTGAAGCAACAATGAGTGAAATGGCAGAGATTATGTATCAAGAAGTTGTGGACTTCAATAAAATATATTCATATTATATCAAGCTTAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804142.1
MDYRSMDTEALDRMLLDSIHELEQQKLVDHHFRQCHSLKEDNGLSFFLDLILIFLNDAEATMSEMAEIMYQEVVDFNKIYSYYIKLKGSSACFGACRIKAACSNLRHAIDNKSKEGCLEALSLMKDEHKNLHDQLNSIIKIEEELFSRAMG

XP_057804150.1
MDYRSMDTEALDRMLLDSIHELEQQKLVDHHFRQCHSLKEDNGLSFFLDLILIFLNDAEATMSEMAEIMYQEVVDFNKIYSYYIKLKGSSAWYSLVLVELKLRALIYAMLLTINPKKGVWRH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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